Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX0

Jag1, Protein jagged-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jag1Q9QXX0 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC46.38■■■■■ 5.02
Jag1Q9QXX0 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
Jag1Q9QXX0 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Jag1Q9QXX0 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
Jag1Q9QXX0 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC40.33■■■■■ 4.05
Jag1Q9QXX0 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.55■■■■□ 3.92
Jag1Q9QXX0 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
Jag1Q9QXX0 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
Jag1Q9QXX0 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.11■■■■□ 3.85
Jag1Q9QXX0 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
Jag1Q9QXX0 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.66■■■■□ 3.78
Jag1Q9QXX0 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Jag1Q9QXX0 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.56■■■■□ 3.76
Jag1Q9QXX0 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Jag1Q9QXX0 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Jag1Q9QXX0 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.63■■■■□ 3.61
Jag1Q9QXX0 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
Jag1Q9QXX0 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Jag1Q9QXX0 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Jag1Q9QXX0 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Jag1Q9QXX0 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Jag1Q9QXX0 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Jag1Q9QXX0 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Jag1Q9QXX0 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Jag1Q9QXX0 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Jag1Q9QXX0 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.48
Jag1Q9QXX0 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Jag1Q9QXX0 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Jag1Q9QXX0 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Jag1Q9QXX0 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
Jag1Q9QXX0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Jag1Q9QXX0 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
Jag1Q9QXX0 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
Jag1Q9QXX0 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Jag1Q9QXX0 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Jag1Q9QXX0 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
Jag1Q9QXX0 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Jag1Q9QXX0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
Jag1Q9QXX0 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Jag1Q9QXX0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.62■■■■□ 3.29
Jag1Q9QXX0 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Jag1Q9QXX0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
Jag1Q9QXX0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Jag1Q9QXX0 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Jag1Q9QXX0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Jag1Q9QXX0 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
Jag1Q9QXX0 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Jag1Q9QXX0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC35.15■■■■□ 3.22
Jag1Q9QXX0 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Jag1Q9QXX0 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Jag1Q9QXX0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
Jag1Q9QXX0 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Jag1Q9QXX0 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Jag1Q9QXX0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Jag1Q9QXX0 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
Jag1Q9QXX0 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Jag1Q9QXX0 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Jag1Q9QXX0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Jag1Q9QXX0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Jag1Q9QXX0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
Jag1Q9QXX0 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Jag1Q9QXX0 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Jag1Q9QXX0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Jag1Q9QXX0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Jag1Q9QXX0 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Jag1Q9QXX0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Jag1Q9QXX0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Jag1Q9QXX0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Jag1Q9QXX0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Jag1Q9QXX0 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
Jag1Q9QXX0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Jag1Q9QXX0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Jag1Q9QXX0 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Jag1Q9QXX0 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Jag1Q9QXX0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Jag1Q9QXX0 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Jag1Q9QXX0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Jag1Q9QXX0 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Jag1Q9QXX0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Jag1Q9QXX0 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Jag1Q9QXX0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Jag1Q9QXX0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Jag1Q9QXX0 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Jag1Q9QXX0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Jag1Q9QXX0 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Jag1Q9QXX0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Jag1Q9QXX0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Jag1Q9QXX0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Jag1Q9QXX0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Jag1Q9QXX0 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Jag1Q9QXX0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Jag1Q9QXX0 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Jag1Q9QXX0 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Jag1Q9QXX0 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Jag1Q9QXX0 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Jag1Q9QXX0 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
Jag1Q9QXX0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Jag1Q9QXX0 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Jag1Q9QXX0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
Jag1Q9QXX0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms