Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEE2

Ctif, CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtifQ6PEE2 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
CtifQ6PEE2 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
CtifQ6PEE2 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
CtifQ6PEE2 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
CtifQ6PEE2 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.73■■■■□ 3.31
CtifQ6PEE2 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
CtifQ6PEE2 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CtifQ6PEE2 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
CtifQ6PEE2 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
CtifQ6PEE2 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CtifQ6PEE2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
CtifQ6PEE2 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
CtifQ6PEE2 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CtifQ6PEE2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.55■■■□□ 2.96
CtifQ6PEE2 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
CtifQ6PEE2 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CtifQ6PEE2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CtifQ6PEE2 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CtifQ6PEE2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CtifQ6PEE2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
CtifQ6PEE2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CtifQ6PEE2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
CtifQ6PEE2 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CtifQ6PEE2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CtifQ6PEE2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CtifQ6PEE2 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CtifQ6PEE2 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CtifQ6PEE2 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CtifQ6PEE2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CtifQ6PEE2 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CtifQ6PEE2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CtifQ6PEE2 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CtifQ6PEE2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CtifQ6PEE2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
CtifQ6PEE2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
CtifQ6PEE2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CtifQ6PEE2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
CtifQ6PEE2 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
CtifQ6PEE2 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
CtifQ6PEE2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CtifQ6PEE2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CtifQ6PEE2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CtifQ6PEE2 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CtifQ6PEE2 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CtifQ6PEE2 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
CtifQ6PEE2 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
CtifQ6PEE2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
CtifQ6PEE2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
CtifQ6PEE2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CtifQ6PEE2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CtifQ6PEE2 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CtifQ6PEE2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CtifQ6PEE2 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
CtifQ6PEE2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
CtifQ6PEE2 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
CtifQ6PEE2 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
CtifQ6PEE2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.78■■■□□ 2.52
CtifQ6PEE2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
CtifQ6PEE2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CtifQ6PEE2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
CtifQ6PEE2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
CtifQ6PEE2 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
CtifQ6PEE2 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CtifQ6PEE2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CtifQ6PEE2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
CtifQ6PEE2 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CtifQ6PEE2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CtifQ6PEE2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CtifQ6PEE2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CtifQ6PEE2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CtifQ6PEE2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
CtifQ6PEE2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CtifQ6PEE2 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
CtifQ6PEE2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CtifQ6PEE2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CtifQ6PEE2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
CtifQ6PEE2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
CtifQ6PEE2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CtifQ6PEE2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CtifQ6PEE2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CtifQ6PEE2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
CtifQ6PEE2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CtifQ6PEE2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
CtifQ6PEE2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
CtifQ6PEE2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
CtifQ6PEE2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CtifQ6PEE2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CtifQ6PEE2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
CtifQ6PEE2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
CtifQ6PEE2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CtifQ6PEE2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
CtifQ6PEE2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CtifQ6PEE2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CtifQ6PEE2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CtifQ6PEE2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CtifQ6PEE2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CtifQ6PEE2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CtifQ6PEE2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CtifQ6PEE2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CtifQ6PEE2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms