RNA–Protein interactions for RNA: YOL093W

TRM10, Transcript of tRNA methyltransferase, yeastyeast

Gene TRM10, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TRM10YOL093W YEL023CP39992 682 aa10.07□□□□□ -0.8
TRM10YOL093W DPS1P04802 557 aaKnown RBP10.06□□□□□ -0.8
TRM10YOL093W DCW1P36091 449 aa10.06□□□□□ -0.8
TRM10YOL093W YDR344CQ05510 147 aa10.03□□□□□ -0.8
TRM10YOL093W CST9Q06032 482 aa10.01□□□□□ -0.81
TRM10YOL093W ARP8Q12386 881 aaKnown RBP RIP-Chip data10.01□□□□□ -0.81not detected
TRM10YOL093W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
TRM10YOL093W RCR1P38212 213 aa9.94□□□□□ -0.82
TRM10YOL093W PML39Q03760 334 aa9.91□□□□□ -0.82
TRM10YOL093W SSP1P38871 571 aa9.89□□□□□ -0.83
TRM10YOL093W RGA1P39083 1007 aa9.87□□□□□ -0.83
TRM10YOL093W MGA2P40578 1113 aa9.85□□□□□ -0.83
TRM10YOL093W SRC1Q03707 834 aa9.85□□□□□ -0.83
TRM10YOL093W ARH1P48360 493 aa9.79□□□□□ -0.84
TRM10YOL093W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
TRM10YOL093W TFA1P36100 482 aa9.73□□□□□ -0.85
TRM10YOL093W MID1P41821 548 aa9.7□□□□□ -0.86
TRM10YOL093W SPT23P35210 1082 aa9.68□□□□□ -0.86
TRM10YOL093W PEX29Q03370 554 aa9.62□□□□□ -0.87
TRM10YOL093W ATH1P48016 1211 aa9.59□□□□□ -0.87
TRM10YOL093W GUT1P32190 709 aa9.57□□□□□ -0.88
TRM10YOL093W NST1P53935 1240 aa9.56□□□□□ -0.88
TRM10YOL093W HAP5Q02516 242 aa9.56□□□□□ -0.88
TRM10YOL093W MIF2P35201 549 aa9.53□□□□□ -0.88
TRM10YOL093W BNI4P53858 892 aa9.53□□□□□ -0.88
TRM10YOL093W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRM10YOL093W PTC2P39966 464 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
TRM10YOL093W PTC3P34221 468 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
TRM10YOL093W RAS1P01119 309 aa9.46□□□□□ -0.9
TRM10YOL093W EDS1P38073 919 aa9.46□□□□□ -0.9
TRM10YOL093W AI4P03878 556 aa9.44□□□□□ -0.9
TRM10YOL093W MPH3P0CE00 602 aa9.44□□□□□ -0.9
TRM10YOL093W SOL3P38858 249 aa9.44□□□□□ -0.9
TRM10YOL093W ILV3P39522 585 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
TRM10YOL093W MPC54Q08550 464 aa9.38□□□□□ -0.91
TRM10YOL093W MAK11P20484 414 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
TRM10YOL093W TRK1P12685 1235 aa9.34□□□□□ -0.91
TRM10YOL093W NMA111P53920 997 aa9.3□□□□□ -0.92
TRM10YOL093W YPR015CQ12531 247 aa9.27□□□□□ -0.93
TRM10YOL093W AMS1P22855 1083 aa9.25□□□□□ -0.93
TRM10YOL093W COQ8P27697 501 aa9.25□□□□□ -0.93
TRM10YOL093W RAM2P29703 316 aa9.25□□□□□ -0.93
TRM10YOL093W YPL062WQ02781 134 aa9.22□□□□□ -0.93
TRM10YOL093W YGR273CP53329 174 aa9.2□□□□□ -0.94
TRM10YOL093W DPL1Q05567 589 aa9.2□□□□□ -0.94
TRM10YOL093W SLI15P38283 698 aa9.17□□□□□ -0.94
TRM10YOL093W GYP1Q08484 637 aa9.17□□□□□ -0.94
TRM10YOL093W RAM1P22007 431 aa9.16□□□□□ -0.94
TRM10YOL093W SDH2P21801 266 aa9.08□□□□□ -0.96
TRM10YOL093W ISU2Q12056 156 aa9.06□□□□□ -0.96
TRM10YOL093W SAS4Q04003 481 aa9.01□□□□□ -0.97
TRM10YOL093W YEL077CQ3E7X8 1277 aa9.01□□□□□ -0.97
TRM10YOL093W PDR1P12383 1068 aa8.97□□□□□ -0.97
TRM10YOL093W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
TRM10YOL093W CDC73Q06697 393 aa8.95□□□□□ -0.98
TRM10YOL093W GAR1P28007 205 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TRM10YOL093W BRE2P43132 505 aa8.92□□□□□ -0.98
TRM10YOL093W KEX1P09620 729 aa8.91□□□□□ -0.98
TRM10YOL093W GBP2P25555 427 aaKnown RBP RIP-Chip data8.91□□□□□ -0.98not detected
TRM10YOL093W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TRM10YOL093W INO80P53115 1489 aa8.85□□□□□ -0.99
TRM10YOL093W AIR1P40507 360 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
TRM10YOL093W GCR2Q01722 534 aa8.82□□□□□ -1
TRM10YOL093W SGS1P35187 1447 aa8.81□□□□□ -1
TRM10YOL093W MON2P48563 1636 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
TRM10YOL093W TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
TRM10YOL093W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
TRM10YOL093W CLA4P48562 842 aa8.74□□□□□ -1.01
TRM10YOL093W PRT1P06103 763 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
TRM10YOL093W ERG12P07277 443 aa8.73□□□□□ -1.01
TRM10YOL093W CST6P40535 587 aa8.71□□□□□ -1.02
TRM10YOL093W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TRM10YOL093W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
TRM10YOL093W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data8.67□□□□□ -1.02not detected
TRM10YOL093W TY1B-DR4Q07793 1604 aa8.67□□□□□ -1.02
TRM10YOL093W UBP14P38237 781 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
TRM10YOL093W VHR2P40041 505 aa8.65□□□□□ -1.02
TRM10YOL093W STR2P47164 639 aa8.65□□□□□ -1.02
TRM10YOL093W MET22P32179 357 aa8.64□□□□□ -1.03
TRM10YOL093W RAD54P32863 898 aa8.63□□□□□ -1.03
TRM10YOL093W LAM6Q08001 693 aa8.62□□□□□ -1.03
TRM10YOL093W YRR1Q12172 810 aa8.62□□□□□ -1.03
TRM10YOL093W ISM1P48526 1002 aa8.61□□□□□ -1.03
TRM10YOL093W ENV9Q08651 330 aa8.6□□□□□ -1.03
TRM10YOL093W CDC4P07834 779 aa8.58□□□□□ -1.04
TRM10YOL093W PEX21P50091 288 aa8.56□□□□□ -1.04
TRM10YOL093W FRK1Q03002 865 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
TRM10YOL093W NUD1P32336 851 aa8.54□□□□□ -1.04
TRM10YOL093W YDR444WQ04093 687 aa8.52□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W SWR1Q05471 1514 aa8.52□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W SPT16P32558 1035 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-DR4O74302 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-AP0CX57 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-PR1P0CX58 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-ORP0CX59 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-PR2P0CX60 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-DR5P0CX65 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-ER2P0CX66 440 aa8.47□□□□□ -1.05
TRM10YOL093W TY1A-GR3P0CX67 440 aa8.47□□□□□ -1.05
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