RNA–Protein interactions for RNA: YNL093W

YPT53, Transcript of Stress-induced Rab family GTPase, yeastyeast

Gene YPT53, Length 663 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPT53YNL093W YDR344CQ05510 147 aa7.16□□□□□ -1.26
YPT53YNL093W PTC4P38089 393 aa7.15□□□□□ -1.26
YPT53YNL093W ABP1P15891 592 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
YPT53YNL093W CHL1P22516 861 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
YPT53YNL093W BCK2P33306 851 aa7.13□□□□□ -1.27
YPT53YNL093W PRE3P38624 215 aa7.12□□□□□ -1.27
YPT53YNL093W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
YPT53YNL093W EDS1P38073 919 aa7.05□□□□□ -1.28
YPT53YNL093W PML39Q03760 334 aa7.05□□□□□ -1.28
YPT53YNL093W GRE2Q12068 342 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
YPT53YNL093W RAM2P29703 316 aa7.02□□□□□ -1.29
YPT53YNL093W MIF2P35201 549 aa7.02□□□□□ -1.29
YPT53YNL093W PTC3P34221 468 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
YPT53YNL093W VRP1P37370 817 aa7□□□□□ -1.29
YPT53YNL093W MID1P41821 548 aa6.99□□□□□ -1.29
YPT53YNL093W NST1P53935 1240 aa6.99□□□□□ -1.29
YPT53YNL093W MAK11P20484 414 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YPT53YNL093W SOL3P38858 249 aa6.97□□□□□ -1.29
YPT53YNL093W ELP4Q02884 456 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
YPT53YNL093W GUT1P32190 709 aa6.96□□□□□ -1.3
YPT53YNL093W ATH1P48016 1211 aa6.96□□□□□ -1.3
YPT53YNL093W TAF7Q05021 590 aa6.96□□□□□ -1.3
YPT53YNL093W XDJ1P39102 459 aa6.95□□□□□ -1.3
YPT53YNL093W COQ8P27697 501 aa6.9□□□□□ -1.3
YPT53YNL093W ILV3P39522 585 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
YPT53YNL093W ARH1P48360 493 aa6.9□□□□□ -1.3
YPT53YNL093W MPH3P0CE00 602 aa6.86□□□□□ -1.31
YPT53YNL093W PEX29Q03370 554 aa6.84□□□□□ -1.31
YPT53YNL093W AI4P03878 556 aa6.83□□□□□ -1.32
YPT53YNL093W DPS1P04802 557 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
YPT53YNL093W SPT23P35210 1082 aa6.81□□□□□ -1.32
YPT53YNL093W YGR273CP53329 174 aa6.78□□□□□ -1.32
YPT53YNL093W HAP5Q02516 242 aa6.78□□□□□ -1.32
YPT53YNL093W MPC54Q08550 464 aa6.76□□□□□ -1.33
YPT53YNL093W SRC1Q03707 834 aa6.74□□□□□ -1.33
YPT53YNL093W BNI4P53858 892 aa6.73□□□□□ -1.33
YPT53YNL093W SLI15P38283 698 aa6.72□□□□□ -1.33
YPT53YNL093W NMA111P53920 997 aa6.72□□□□□ -1.33
YPT53YNL093W YML082WQ04533 649 aaKnown RBP6.72□□□□□ -1.33
YPT53YNL093W PTC2P39966 464 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
YPT53YNL093W NOP53Q12080 455 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
YPT53YNL093W YPR015CQ12531 247 aa6.67□□□□□ -1.34
YPT53YNL093W RAS1P01119 309 aa6.65□□□□□ -1.34
YPT53YNL093W DPL1Q05567 589 aa6.65□□□□□ -1.34
YPT53YNL093W KEX1P09620 729 aa6.62□□□□□ -1.35
YPT53YNL093W RAM1P22007 431 aa6.62□□□□□ -1.35
YPT53YNL093W CDC73Q06697 393 aa6.61□□□□□ -1.35
YPT53YNL093W PDR1P12383 1068 aa6.56□□□□□ -1.36
YPT53YNL093W ISU2Q12056 156 aa6.56□□□□□ -1.36
YPT53YNL093W UBP14P38237 781 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
YPT53YNL093W YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
YPT53YNL093W SDH2P21801 266 aa6.52□□□□□ -1.37
YPT53YNL093W VHR2P40041 505 aa6.52□□□□□ -1.37
YPT53YNL093W PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data6.51□□□□□ -1.37not detected
YPT53YNL093W SET1P38827 1080 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
YPT53YNL093W RGA2Q06407 1009 aa6.51□□□□□ -1.37
YPT53YNL093W GYP1Q08484 637 aa6.5□□□□□ -1.37
YPT53YNL093W RGA1P39083 1007 aa6.48□□□□□ -1.37
YPT53YNL093W AMS1P22855 1083 aa6.46□□□□□ -1.38
YPT53YNL093W RAD54P32863 898 aa6.43□□□□□ -1.38
YPT53YNL093W YDR090CQ03193 310 aa6.41□□□□□ -1.38
YPT53YNL093W TRK1P12685 1235 aa6.4□□□□□ -1.38
YPT53YNL093W BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
YPT53YNL093W SAS4Q04003 481 aa6.38□□□□□ -1.39
YPT53YNL093W YRR1Q12172 810 aa6.37□□□□□ -1.39
YPT53YNL093W STR2P47164 639 aa6.35□□□□□ -1.39
YPT53YNL093W ISM1P48526 1002 aa6.34□□□□□ -1.39
YPT53YNL093W GAP1P19145 602 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W PRT1P06103 763 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W YEL077CQ3E7X8 1277 aa6.31□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W RPP1BP10622 106 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W CLA4P48562 842 aa6.29□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W TUM1Q08686 304 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W NUD1P32336 851 aa6.28□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W KIC1P38692 1080 aa6.28□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W AIR1P40507 360 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W CST6P40535 587 aa6.28□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W PEX21P50091 288 aa6.28□□□□□ -1.4
YPT53YNL093W MRF1P30775 413 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-DR4O74302 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-HP0C2I4 478 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-AP0CX57 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-PR1P0CX58 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-ORP0CX59 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-PR2P0CX60 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-DR5P0CX65 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-ER2P0CX66 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-GR3P0CX67 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-LR1P0CX68 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-MR2P0CX69 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-JR2P47099 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-DR1Q03856 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-ML1Q04706 440 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-BRQ12217 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-NL2Q12470 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TY1A-GR2Q12485 440 aa6.26□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W SEC2P17065 759 aa6.25□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W CSC1Q06538 782 aa6.25□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W TFB4Q12004 338 aa6.25□□□□□ -1.41
YPT53YNL093W ORC6P38826 435 aa6.24□□□□□ -1.41
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