RNA–Protein interactions for RNA: YJL054W

TIM54, Transcript of Component of the mitochondrial TIM22 complex, yeastyeast

Gene TIM54, Length 1,437 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TIM54YJL054W POL1P13382 1468 aa8.96□□□□□ -0.97
TIM54YJL054W RKR1Q04781 1562 aa8.95□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W LTE1P07866 1435 aa8.95□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W MMS22Q06164 1454 aa8.95□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY2B-BQ12491 1770 aa8.93□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W RPA190P10964 1664 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-HO13535 1793 aa8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-DR5P0C2I2 1755 aa8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-DR6P0C2I3 1755 aa8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-LR2P0C2I5 1755 aa8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-LR3P0C2I6 1755 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-PR1P0C2I9 1755 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-PR2P0C2J0 1756 aa8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-PR3P0C2J1 1755 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-JR1P47098 1755 aa8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-ML2Q03434 1755 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-ER1Q03612 1755 aa8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-ML1Q04711 1755 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-GR2Q12269 1755 aa8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-OLQ12273 1755 aa8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-PLQ12414 1755 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W AI2P03876 854 aa8.91□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TY1B-DR3Q99231 1755 aa8.91□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W SMC4Q12267 1418 aa8.9□□□□□ -0.98
TIM54YJL054W TRM732Q03496 1420 aa8.89□□□□□ -0.99
TIM54YJL054W YOR1P53049 1477 aa8.89□□□□□ -0.99
TIM54YJL054W BBC1P47068 1157 aa8.88□□□□□ -0.99
TIM54YJL054W STU1P38198 1513 aa8.88□□□□□ -0.99
TIM54YJL054W EPS1P40557 701 aa8.88□□□□□ -0.99
TIM54YJL054W SPP41P38904 1435 aa8.85□□□□□ -0.99
TIM54YJL054W ITT1Q04638 464 aa8.84□□□□□ -0.99
TIM54YJL054W GEA2P39993 1459 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
TIM54YJL054W MIF2P35201 549 aa8.83□□□□□ -1
TIM54YJL054W BNI1P41832 1953 aa8.81□□□□□ -1
TIM54YJL054W BDF1P35817 686 aa8.81□□□□□ -1
TIM54YJL054W MGA2P40578 1113 aa8.8□□□□□ -1
TIM54YJL054W TSC11P40061 1430 aa8.8□□□□□ -1
TIM54YJL054W NUP159P40477 1460 aa8.79□□□□□ -1
TIM54YJL054W PSD2P53037 1138 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W CST9Q06032 482 aa8.76□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W YRF1-1P0CX20 1796 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W YRF1-5P0CX21 1796 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W YRF1-8P0CX22 1796 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W VTH1P40438 1549 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W VTH2P40890 1549 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W TY1B-JR2P47100 1755 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W TY1B-ER2Q03619 1755 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W TY1B-MR1Q04214 1755 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W TY1B-MR2Q04670 1755 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W TY1B-LR1Q12088 1755 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W TY1B-NL1Q12112 1755 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W TY1B-GR1Q12141 1755 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W TY1B-BLQ12490 1755 aa8.75□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W YTA7P40340 1379 aa8.74□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W VPS15P22219 1454 aa8.73□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W MYO4P32492 1471 aa8.72□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W DRS2P39524 1355 aa8.72□□□□□ -1.01
TIM54YJL054W ABP1P15891 592 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
TIM54YJL054W MMS1Q06211 1407 aa8.7□□□□□ -1.02
TIM54YJL054W NTE1Q04958 1679 aa8.7□□□□□ -1.02
TIM54YJL054W SNT2P53127 1403 aa8.68□□□□□ -1.02
TIM54YJL054W RPO21P04050 1733 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
TIM54YJL054W STH1P32597 1359 aa8.66□□□□□ -1.02
TIM54YJL054W MRM1P25270 412 aa8.66□□□□□ -1.02
TIM54YJL054W MET10P39692 1035 aa8.66□□□□□ -1.02
TIM54YJL054W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
TIM54YJL054W YBL029C-AQ3E756 94 aa8.63□□□□□ -1.03
TIM54YJL054W RTT106P40161 455 aa8.61□□□□□ -1.03
TIM54YJL054W NUP170P38181 1502 aa8.57□□□□□ -1.04
TIM54YJL054W DMA1P38823 416 aa8.56□□□□□ -1.04
TIM54YJL054W MST1P07236 462 aa8.54□□□□□ -1.04
TIM54YJL054W PDR12Q02785 1511 aa8.54□□□□□ -1.04
TIM54YJL054W YFR006WP43590 535 aa8.54□□□□□ -1.04
TIM54YJL054W SPO14P36126 1683 aa8.52□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W ULS1Q08562 1619 aa8.52□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W IRC20Q06554 1556 aa8.51□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W RTG3P38165 486 aa8.51□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W DNF2Q12675 1612 aa8.5□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W RCR1P38212 213 aa8.48□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W VNX1P42839 908 aa8.48□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W YOR238WQ08634 303 aa8.48□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W TAF7Q05021 590 aa8.47□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W MLP2P40457 1679 aa8.47□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W IQG1Q12280 1495 aa8.47□□□□□ -1.05
TIM54YJL054W GDB1Q06625 1536 aa8.46□□□□□ -1.06
TIM54YJL054W TRM3Q07527 1436 aa8.45□□□□□ -1.06
TIM54YJL054W PDR10P51533 1564 aa8.43□□□□□ -1.06
TIM54YJL054W YJL171CP46992 396 aa8.43□□□□□ -1.06
TIM54YJL054W AIR2Q12476 344 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
TIM54YJL054W BUD3P25558 1636 aa8.42□□□□□ -1.06
TIM54YJL054W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
TIM54YJL054W DOP1Q03921 1698 aa8.41□□□□□ -1.06
TIM54YJL054W SPP1Q03012 353 aa8.4□□□□□ -1.06
TIM54YJL054W VPS29P38759 282 aa8.39□□□□□ -1.07
TIM54YJL054W RAM2P29703 316 aa8.38□□□□□ -1.07
TIM54YJL054W IFH1P39520 1085 aa8.37□□□□□ -1.07
TIM54YJL054W YAP5P40574 245 aa8.37□□□□□ -1.07
TIM54YJL054W YMR1P47147 688 aaKnown RBP RIP-Chip data8.36□□□□□ -1.07not detected
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