RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629943.2

PCBP1-AS1-355, PCBP1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene PCBP1-AS1, Length 725 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 C7P10643 843 aa11.45□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SLC39A7Q92504 469 aa11.45□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KIF12Q96FN5 646 aa11.45□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 METRNQ9UJH8 293 aa11.43□□□□□ -0.58
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PLEKHG5O94827 1062 aa11.39□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 POTEJP0CG39 1038 aa11.38□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RASEFQ8IZ41 740 aa11.37□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MIER1Q8N108 512 aa11.37□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TIE1P35590 1138 aa11.33□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MAP3K13O43283 966 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.32□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SGIP1Q9BQI5 828 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRPC6Q9Y210 931 aa11.3□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 POTEFA5A3E0 1075 aa11.29□□□□□ -0.6
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 NUBP1P53384 320 aa11.27□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 POTEMA6NI47 508 aa11.25□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PLCD3Q8N3E9 789 aa11.25□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TTLL13PA6NNM8 815 aa11.23□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 POTEGQ6S5H5 508 aa11.22□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.21□□□□□ -0.61
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 IER5LQ5T953 404 aa11.19□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PLSCR2Q9NRY7 297 aa11.19□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PCDH10Q9P2E7 1040 aa11.19□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.17□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FKBP8Q14318 412 aa11.14□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FAM212AQ96EL1 285 aa11.14□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRIM35Q9UPQ4 493 aa11.14□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 IFNL1Q8IU54 200 aa11.13□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SEC24BO95487 1268 aa11.09□□□□□ -0.63
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TMEM106CQ9BVX2 250 aa11.04□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FBXO3Q9UK99 471 aa11.04□□□□□ -0.64
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PLCG2P16885 1265 aa10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DCAF8Q5TAQ9 597 aa10.96□□□□□ -0.65
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PYGBP11216 843 aa10.95□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 OCEL1Q9H607 264 aa10.94□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.92□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 VASPP50552 380 aaPredicted RBP10.9□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PCDHB8Q9UN66 801 aa10.9□□□□□ -0.66
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GSE1Q14687 1217 aa10.89□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ST18O60284 1047 aa10.87□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.83□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KLHL34Q8N239 644 aa10.8□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP10.79□□□□□ -0.68
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SNPHO15079 494 aa10.77□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PSEN1P49768 467 aa10.74□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GOLGA2Q08379 1002 aa10.7□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP10.7□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SPOCK2Q92563 424 aa10.69□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP10.68□□□□□ -0.72e-9■■□□□ 12.3
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 C3orf67Q6ZVT6 689 aa10.67□□□□□ -0.7
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SPNS2Q8IVW8 549 aa10.61□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MARVELD3Q96A59 401 aa10.61□□□□□ -0.71
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MMRN1Q13201 1228 aa10.58□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DPY19L2Q6NUT2 758 aa10.58□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TRIM41Q8WV44 630 aa10.58□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CABP2Q9NPB3 220 aa10.58□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.56□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 EMP3P54852 163 aa10.54□□□□□ -0.72
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 POTEB3A0JP26 581 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 POTEBQ6S5H4 581 aa10.52□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HS3ST6Q96QI5 342 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa10.51□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 G3V3G9 751 aa10.46□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP10.46□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.46□□□□□ -0.73
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 FAM205CA6NFA0 338 aa10.45□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 SOX12O15370 315 aa10.41□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 DOK7Q18PE1 504 aa10.41□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP10.4□□□□□ -0.74
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP10.39□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MICALL2Q8IY33 904 aa10.39□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 TMEM92Q6UXU6 159 aa10.37□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.37□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.37□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.36□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 VGFO15240 615 aaPredicted RBP10.35□□□□□ -0.75
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 RIMBP2O15034 1052 aa10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP10.33□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 ERBB3P21860 1342 aa10.31□□□□□ -0.76
PCBP1-AS1-355ENST00000629943 GPR153Q6NV75 609 aa10.3□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms