RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617444.4

SLC35E2B-205, Transcript of solute carrier family 35 member E2B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC35E2B, Length 6,283 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35E2B-205ENST00000617444 MRS2Q9HD23 443 aa18.05■□□□□ 0.48
SLC35E2B-205ENST00000617444 NCLP19338 710 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SLC35E2B-205ENST00000617444 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.02■□□□□ 0.48
SLC35E2B-205ENST00000617444 BECN1Q14457 450 aa18.01■□□□□ 0.47
SLC35E2B-205ENST00000617444 TSPY4P0CV99 314 aa18■□□□□ 0.47
SLC35E2B-205ENST00000617444 TSPY10P0CW01 314 aa18■□□□□ 0.47
SLC35E2B-205ENST00000617444 GOLGA6L22H0YM25 854 aa17.99■□□□□ 0.47
SLC35E2B-205ENST00000617444 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP17.99■□□□□ 0.47
SLC35E2B-205ENST00000617444 DDRGK1Q96HY6 314 aa17.98■□□□□ 0.47
SLC35E2B-205ENST00000617444 KCNH8Q96L42 1107 aa17.97■□□□□ 0.47
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.97■□□□□ 0.47
SLC35E2B-205ENST00000617444 LMOD2Q6P5Q4 547 aa17.97■□□□□ 0.47
SLC35E2B-205ENST00000617444 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP17.96■□□□□ 0.46
SLC35E2B-205ENST00000617444 TAOK2Q9UL54 1235 aa17.94■□□□□ 0.46
SLC35E2B-205ENST00000617444 TPRNQ4KMQ1 711 aa17.91■□□□□ 0.46
SLC35E2B-205ENST00000617444 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP17.91■□□□□ 0.46
SLC35E2B-205ENST00000617444 PTMAP06454 111 aaKnown RBP17.9■□□□□ 0.46
SLC35E2B-205ENST00000617444 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP17.9■□□□□ 0.46
SLC35E2B-205ENST00000617444 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
SLC35E2B-205ENST00000617444 ERICH6BQ5W0A0 696 aa17.82■□□□□ 0.44
SLC35E2B-205ENST00000617444 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
SLC35E2B-205ENST00000617444 MIER1Q8N108 512 aa17.8■□□□□ 0.44
SLC35E2B-205ENST00000617444 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP17.79■□□□□ 0.44
SLC35E2B-205ENST00000617444 TRHP20396 242 aaPredicted RBP17.79■□□□□ 0.44
SLC35E2B-205ENST00000617444 RGL3Q3MIN7 710 aa17.78■□□□□ 0.44
SLC35E2B-205ENST00000617444 CASC1Q6TDU7 716 aa17.77■□□□□ 0.44
SLC35E2B-205ENST00000617444 CLSTN1O94985 981 aa17.77■□□□□ 0.44
SLC35E2B-205ENST00000617444 MTUS2Q5JR59 1369 aa17.77■□□□□ 0.43
SLC35E2B-205ENST00000617444 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
SLC35E2B-205ENST00000617444 GOLGA2Q08379 1002 aa17.75■□□□□ 0.43
SLC35E2B-205ENST00000617444 CFAP53Q96M91 514 aa17.74■□□□□ 0.43
SLC35E2B-205ENST00000617444 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.73■□□□□ 0.43
SLC35E2B-205ENST00000617444 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
SLC35E2B-205ENST00000617444 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa17.71■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP17.69■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 POGKQ9P215 609 aa17.69■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP17.69■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 PLCB2Q00722 1185 aa17.68■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 SCRIBQ14160 1630 aa17.68■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 PLEKHD1A6NEE1 506 aa17.67■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 NEUROD2Q15784 382 aa17.66■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa17.65■□□□□ 0.42
SLC35E2B-205ENST00000617444 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa17.64■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 FGD1P98174 961 aa17.64■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 NRDCO43847 1150 aa17.63■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa17.62■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 KNSTRNQ9Y448 316 aa17.62■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 CDCA8Q53HL2 280 aa17.61■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 MLECQ14165 292 aa17.61■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 SOX12O15370 315 aa17.6■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP17.6■□□□□ 0.41
SLC35E2B-205ENST00000617444 RGS3P49796 1198 aa17.58■□□□□ 0.4
SLC35E2B-205ENST00000617444 KCNJ4P48050 445 aa17.58■□□□□ 0.4
SLC35E2B-205ENST00000617444 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP17.56■□□□□ 0.4
SLC35E2B-205ENST00000617444 NUDCQ9Y266 331 aa17.55■□□□□ 0.4
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP17.55■□□□□ 0.4
SLC35E2B-205ENST00000617444 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
SLC35E2B-205ENST00000617444 PPP4R2Q9NY27 417 aa17.53■□□□□ 0.4
SLC35E2B-205ENST00000617444 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
SLC35E2B-205ENST00000617444 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP17.53■□□□□ 0.4
SLC35E2B-205ENST00000617444 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa17.52■□□□□ 0.39
SLC35E2B-205ENST00000617444 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP17.52■□□□□ 0.39
SLC35E2B-205ENST00000617444 MS4A1P11836 297 aa17.49■□□□□ 0.39
SLC35E2B-205ENST00000617444 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP17.48■□□□□ 0.39
SLC35E2B-205ENST00000617444 CARD11Q9BXL7 1154 aa17.48■□□□□ 0.39
SLC35E2B-205ENST00000617444 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP17.47■□□□□ 0.39
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP17.46■□□□□ 0.39
SLC35E2B-205ENST00000617444 PRM3Q9NNZ6 103 aa17.46■□□□□ 0.39
SLC35E2B-205ENST00000617444 MSNP26038 577 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP17.44■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 HSCBQ8IWL3 235 aa17.44■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 ERCC6Q03468 1493 aa17.43■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP17.43■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 CLIP1P30622 1438 aa17.41■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa17.41■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP17.41■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 HDGFP51858 240 aaKnown RBP17.4■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP17.4■□□□□ 0.38
SLC35E2B-205ENST00000617444 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 DRC7Q8IY82 874 aa17.39■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP17.38■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 MCCP23508 829 aa17.37■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa17.36■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 G3V3G9 751 aa17.34■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 DCAF8Q5TAQ9 597 aa17.34■□□□□ 0.37
SLC35E2B-205ENST00000617444 CFAP44Q96MT7 982 aa17.32■□□□□ 0.36
SLC35E2B-205ENST00000617444 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
SLC35E2B-205ENST00000617444 STK26Q9P289 416 aa17.31■□□□□ 0.36
SLC35E2B-205ENST00000617444 KANK1Q14678 1352 aa17.31■□□□□ 0.36
SLC35E2B-205ENST00000617444 DEKP35659 375 aaKnown RBP17.3■□□□□ 0.36
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