RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa28.25■■■□□ 2.11
PTPRM-211ENST00000580170 MYH16Q9H6N6 1097 aa28.24■■■□□ 2.11
PTPRM-211ENST00000580170 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.22■■■□□ 2.11
PTPRM-211ENST00000580170 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.21■■■□□ 2.11
PTPRM-211ENST00000580170 BECN1Q14457 450 aa28.15■■■□□ 2.1
PTPRM-211ENST00000580170 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
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PTPRM-211ENST00000580170 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP28.13■■■□□ 2.09
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PTPRM-211ENST00000580170 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa28.05■■■□□ 2.08
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PTPRM-211ENST00000580170 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
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PTPRM-211ENST00000580170 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
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PTPRM-211ENST00000580170 KCNH8Q96L42 1107 aa27.88■■■□□ 2.05
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PTPRM-211ENST00000580170 CARD11Q9BXL7 1154 aa27.86■■■□□ 2.05
PTPRM-211ENST00000580170 PLEKHD1A6NEE1 506 aa27.85■■■□□ 2.05
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PTPRM-211ENST00000580170 PPP4R2Q9NY27 417 aa27.83■■■□□ 2.05
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PTPRM-211ENST00000580170 CASC1Q6TDU7 716 aa27.78■■■□□ 2.04
PTPRM-211ENST00000580170 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP27.78■■■□□ 2.04
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PTPRM-211ENST00000580170 KIF27Q86VH2 1401 aa27.69■■■□□ 2.02
PTPRM-211ENST00000580170 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.67■■■□□ 2.02
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PTPRM-211ENST00000580170 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
PTPRM-211ENST00000580170 CCER2I3L3R5 266 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRM-211ENST00000580170 DCAF11Q8TEB1 546 aa27.42■■□□□ 1.98
PTPRM-211ENST00000580170 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP27.38■■□□□ 1.97
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PTPRM-211ENST00000580170 HSCBQ8IWL3 235 aa27.37■■□□□ 1.97
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PTPRM-211ENST00000580170 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa27.35■■□□□ 1.97
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PTPRM-211ENST00000580170 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP27.34■■□□□ 1.97
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PTPRM-211ENST00000580170 KCNJ4P48050 445 aa27.3■■□□□ 1.96
PTPRM-211ENST00000580170 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa27.29■■□□□ 1.96
PTPRM-211ENST00000580170 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP27.29■■□□□ 1.96
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PTPRM-211ENST00000580170 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
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PTPRM-211ENST00000580170 MORC1Q86VD1 984 aa27.24■■□□□ 1.95
PTPRM-211ENST00000580170 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
PTPRM-211ENST00000580170 KANK1Q14678 1352 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRM-211ENST00000580170 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.21■■□□□ 1.95
PTPRM-211ENST00000580170 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa27.2■■□□□ 1.95
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