RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550135.5

AC008969.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC008969.1, Length 6,438 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC008969.1-201ENST00000550135 TSPY10P0CW01 314 aa21.79■■□□□ 1.08
AC008969.1-201ENST00000550135 C14orf37Q86TY3 774 aa21.71■■□□□ 1.07
AC008969.1-201ENST00000550135 MYH16Q9H6N6 1097 aa21.71■■□□□ 1.07
AC008969.1-201ENST00000550135 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
AC008969.1-201ENST00000550135 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP21.68■■□□□ 1.06
AC008969.1-201ENST00000550135 CLIP1P30622 1438 aa21.68■■□□□ 1.06
AC008969.1-201ENST00000550135 KCNH8Q96L42 1107 aa21.67■■□□□ 1.06
AC008969.1-201ENST00000550135 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
AC008969.1-201ENST00000550135 RGL3Q3MIN7 710 aa21.65■■□□□ 1.06
AC008969.1-201ENST00000550135 MYO15BQ96JP2 1530 aa21.6■■□□□ 1.05
AC008969.1-201ENST00000550135 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
AC008969.1-201ENST00000550135 TPRNQ4KMQ1 711 aa21.58■■□□□ 1.05
AC008969.1-201ENST00000550135 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa21.58■■□□□ 1.04
AC008969.1-201ENST00000550135 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
AC008969.1-201ENST00000550135 DDRGK1Q96HY6 314 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008969.1-201ENST00000550135 BECN1Q14457 450 aa21.51■■□□□ 1.03
AC008969.1-201ENST00000550135 NCLP19338 710 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
AC008969.1-201ENST00000550135 CEP162Q5TB80 1403 aa21.49■■□□□ 1.03
AC008969.1-201ENST00000550135 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
AC008969.1-201ENST00000550135 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
AC008969.1-201ENST00000550135 NEUROD2Q15784 382 aa21.47■■□□□ 1.03
AC008969.1-201ENST00000550135 GOLGA3Q08378 1498 aa21.46■■□□□ 1.03
AC008969.1-201ENST00000550135 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 PLEKHD1A6NEE1 506 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 KNSTRNQ9Y448 316 aa21.43■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.42■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 CFAP53Q96M91 514 aa21.41■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP21.4■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP21.39■■□□□ 1.02
AC008969.1-201ENST00000550135 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
AC008969.1-201ENST00000550135 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.38■■□□□ 1.01
AC008969.1-201ENST00000550135 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.38■■□□□ 1.01
AC008969.1-201ENST00000550135 GOLGA6L22H0YM25 854 aa21.36■■□□□ 1.01
AC008969.1-201ENST00000550135 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
AC008969.1-201ENST00000550135 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
AC008969.1-201ENST00000550135 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
AC008969.1-201ENST00000550135 RGS3P49796 1198 aa21.33■■□□□ 1
AC008969.1-201ENST00000550135 CASC1Q6TDU7 716 aa21.33■■□□□ 1
AC008969.1-201ENST00000550135 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.33■■□□□ 1
AC008969.1-201ENST00000550135 PTMAP06454 111 aaKnown RBP21.32■■□□□ 1
AC008969.1-201ENST00000550135 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa21.3■■□□□ 1
AC008969.1-201ENST00000550135 CDCA8Q53HL2 280 aa21.28■■□□□ 1
AC008969.1-201ENST00000550135 LMOD2Q6P5Q4 547 aa21.28■■□□□ 1
AC008969.1-201ENST00000550135 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa21.27■■□□□ 1
AC008969.1-201ENST00000550135 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP21.27■■□□□ 1
AC008969.1-201ENST00000550135 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.25■□□□□ 0.99
AC008969.1-201ENST00000550135 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP21.25■□□□□ 0.99
AC008969.1-201ENST00000550135 POGKQ9P215 609 aa21.25■□□□□ 0.99
AC008969.1-201ENST00000550135 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP21.24■□□□□ 0.99
AC008969.1-201ENST00000550135 ANP32EQ9BTT0 268 aa21.23■□□□□ 0.99
AC008969.1-201ENST00000550135 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP21.22■□□□□ 0.99
AC008969.1-201ENST00000550135 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.21■□□□□ 0.99
AC008969.1-201ENST00000550135 EEA1Q15075 1411 aa21.2■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa21.2■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 PPP4R2Q9NY27 417 aa21.2■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 PLCB2Q00722 1185 aa21.19■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 NUDCQ9Y266 331 aa21.18■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 KIF27Q86VH2 1401 aa21.17■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 CEP164Q9UPV0 1460 aa21.16■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.98
AC008969.1-201ENST00000550135 TNIKQ9UKE5 1360 aa21.14■□□□□ 0.97
AC008969.1-201ENST00000550135 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
AC008969.1-201ENST00000550135 SOX12O15370 315 aa21.13■□□□□ 0.97
AC008969.1-201ENST00000550135 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
AC008969.1-201ENST00000550135 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa21.11■□□□□ 0.97
AC008969.1-201ENST00000550135 DCAF11Q8TEB1 546 aa21.11■□□□□ 0.97
AC008969.1-201ENST00000550135 NPHP1O15259 732 aa21.11■□□□□ 0.97
AC008969.1-201ENST00000550135 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.96
AC008969.1-201ENST00000550135 FGD1P98174 961 aa21.06■□□□□ 0.96
AC008969.1-201ENST00000550135 CCNB3Q8WWL7 1395 aa21.06■□□□□ 0.96
AC008969.1-201ENST00000550135 KCNJ4P48050 445 aa21.05■□□□□ 0.96
AC008969.1-201ENST00000550135 ERCC6Q03468 1493 aa21.04■□□□□ 0.96
AC008969.1-201ENST00000550135 TMF1P82094 1093 aa21.04■□□□□ 0.96
AC008969.1-201ENST00000550135 MLECQ14165 292 aa21.03■□□□□ 0.96
AC008969.1-201ENST00000550135 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP21.01■□□□□ 0.95
AC008969.1-201ENST00000550135 FOXD1Q16676 465 aa20.99■□□□□ 0.95
AC008969.1-201ENST00000550135 ERICH6BQ5W0A0 696 aa20.98■□□□□ 0.95
AC008969.1-201ENST00000550135 HSCBQ8IWL3 235 aa20.97■□□□□ 0.95
AC008969.1-201ENST00000550135 MORC1Q86VD1 984 aa20.97■□□□□ 0.95
AC008969.1-201ENST00000550135 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP20.97■□□□□ 0.95
AC008969.1-201ENST00000550135 APBB1O00213 710 aa20.95■□□□□ 0.94
AC008969.1-201ENST00000550135 MS4A1P11836 297 aa20.95■□□□□ 0.94
AC008969.1-201ENST00000550135 GOLGA2Q08379 1002 aa20.95■□□□□ 0.94
AC008969.1-201ENST00000550135 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP20.95■□□□□ 0.94
AC008969.1-201ENST00000550135 STK26Q9P289 416 aa20.94■□□□□ 0.94
AC008969.1-201ENST00000550135 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP20.94■□□□□ 0.94
AC008969.1-201ENST00000550135 KANK1Q14678 1352 aa20.93■□□□□ 0.94
AC008969.1-201ENST00000550135 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa20.92■□□□□ 0.94
AC008969.1-201ENST00000550135 SOGA1O94964 1423 aa20.91■□□□□ 0.94
AC008969.1-201ENST00000550135 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa20.89■□□□□ 0.93
AC008969.1-201ENST00000550135 CUX2O14529 1486 aa20.88■□□□□ 0.93
AC008969.1-201ENST00000550135 FHAD1B1AJZ9 1412 aa20.87■□□□□ 0.93
AC008969.1-201ENST00000550135 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms