RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
RNU6-162P-201ENST00000516228 STAG3Q9UJ98 1225 aa5.84□□□□□ -1.47
RNU6-162P-201ENST00000516228 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPNS2Q8IVW8 549 aa5.82□□□□□ -1.48
RNU6-162P-201ENST00000516228 PHF12Q96QT6 1004 aa5.81□□□□□ -1.48
RNU6-162P-201ENST00000516228 CREBZFQ9NS37 354 aa5.8□□□□□ -1.48
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
RNU6-162P-201ENST00000516228 MS4A3Q96HJ5 214 aa5.75□□□□□ -1.49
RNU6-162P-201ENST00000516228 ST18O60284 1047 aa5.73□□□□□ -1.49
RNU6-162P-201ENST00000516228 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNPHO15079 494 aa5.7□□□□□ -1.5
RNU6-162P-201ENST00000516228 SEC24BO95487 1268 aa5.69□□□□□ -1.5
RNU6-162P-201ENST00000516228 IER5LQ5T953 404 aa5.68□□□□□ -1.5
RNU6-162P-201ENST00000516228 POTEFA5A3E0 1075 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-162P-201ENST00000516228 TIE1P35590 1138 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLAIN1Q8ND83 568 aa5.67□□□□□ -1.5
RNU6-162P-201ENST00000516228 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
RNU6-162P-201ENST00000516228 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZBTB22O15209 634 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-162P-201ENST00000516228 KIF12Q96FN5 646 aa5.59□□□□□ -1.51
RNU6-162P-201ENST00000516228 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.51
RNU6-162P-201ENST00000516228 CCDC61Q9Y6R9 512 aa5.58□□□□□ -1.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TTLL13PA6NNM8 815 aa5.55□□□□□ -1.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 SGIP1Q9BQI5 828 aa5.54□□□□□ -1.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLCG2P16885 1265 aa5.53□□□□□ -1.52
RNU6-162P-201ENST00000516228 EMP3P54852 163 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 MARVELD3Q96A59 401 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP5.52□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRIM35Q9UPQ4 493 aa5.52□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.51□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 MAP3K13O43283 966 aa5.5□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 HS3ST6Q96QI5 342 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 TRPC6Q9Y210 931 aa5.48□□□□□ -1.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM205CA6NFA0 338 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLEKHG5O94827 1062 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 PTGER2P43116 358 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 OCEL1Q9H607 264 aa5.44□□□□□ -1.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPDYE4A6NLX3 237 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 MYT1LQ9UL68 1186 aa5.41□□□□□ -1.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa5.4□□□□□ -1.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 C3orf67Q6ZVT6 689 aa5.39□□□□□ -1.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM106CQ9BVX2 250 aa5.38□□□□□ -1.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 POTEB3A0JP26 581 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 POTEBQ6S5H4 581 aa5.37□□□□□ -1.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
RNU6-162P-201ENST00000516228 RASEFQ8IZ41 740 aa5.32□□□□□ -1.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 IFNL1Q8IU54 200 aa5.31□□□□□ -1.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 ERBB3P21860 1342 aa5.3□□□□□ -1.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP5.29□□□□□ -1.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF710Q8N1W2 664 aa5.28□□□□□ -1.56
RNU6-162P-201ENST00000516228 RIMBP2O15034 1052 aa5.27□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 DOK7Q18PE1 504 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa5.26□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF687Q8N1G0 1237 aa5.25□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 RGS20O76081 388 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 MIER1Q8N108 512 aa5.24□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP5.23□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM212AQ96EL1 285 aa5.23□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.22□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa5.22□□□□□ -1.57
RNU6-162P-201ENST00000516228 G3V3G9 751 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP5.21□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 GOLGA2Q08379 1002 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 DCAF8Q5TAQ9 597 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 PROM2Q8N271 834 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 HCSTQ9UBK5 93 aa5.21□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUBP1P53384 320 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLCD3Q8N3E9 789 aa5.14□□□□□ -1.59
RNU6-162P-201ENST00000516228 PBX2P40425 430 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-162P-201ENST00000516228 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-162P-201ENST00000516228 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-162P-201ENST00000516228 BOLA1Q9Y3E2 137 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-162P-201ENST00000516228 IFFO2Q5TF58 517 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-162P-201ENST00000516228 PCDHB8Q9UN66 801 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-162P-201ENST00000516228 GPR153Q6NV75 609 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-162P-201ENST00000516228 PYGBP11216 843 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-162P-201ENST00000516228 PSEN1P49768 467 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 DPY19L2Q6NUT2 758 aa4.99□□□□□ -1.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 GSE1Q14687 1217 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 LAPTM4AQ15012 233 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 Q6ZNB5 142 aa4.98□□□□□ -1.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
RNU6-162P-201ENST00000516228 A0A0G2JS52 829 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 TK2O00142 265 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 ADGRD1Q6QNK2 874 aa4.96□□□□□ -1.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 ARSIQ5FYB1 569 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-162P-201ENST00000516228 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP4.94□□□□□ -1.62
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