RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495357.1

CCDC39-AS1-201, CCDC39 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene CCDC39-AS1, Length 283 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KIF12Q96FN5 646 aa15.46■□□□□ 0.07
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RASEFQ8IZ41 740 aa15.45■□□□□ 0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POTEJP0CG39 1038 aa15.43■□□□□ 0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MIER1Q8N108 512 aa15.43■□□□□ 0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 METRNQ9UJH8 293 aa15.41■□□□□ 0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRPC6Q9Y210 931 aa15.41■□□□□ 0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLC39A7Q92504 469 aa15.36■□□□□ 0.05
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAP3K13O43283 966 aa15.35■□□□□ 0.05
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C7P10643 843 aa15.35■□□□□ 0.05
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP15.34■□□□□ 0.05
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POTEFA5A3E0 1075 aa15.31■□□□□ 0.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLEKHG5O94827 1062 aa15.29■□□□□ 0.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 NUBP1P53384 320 aa15.29■□□□□ 0.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FKBP8Q14318 412 aa15.27■□□□□ 0.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.26■□□□□ 0.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TIE1P35590 1138 aa15.24■□□□□ 0.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TTLL13PA6NNM8 815 aa15.19■□□□□ 0.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.15■□□□□ 0.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POTEMA6NI47 508 aa15.12■□□□□ 0.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa15.11■□□□□ 0.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFNL1Q8IU54 200 aa15.1■□□□□ 0.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POTEGQ6S5H5 508 aa15.08■□□□□ 0
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.06■□□□□ 0
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLSCR2Q9NRY7 297 aa15.05■□□□□ -0
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM212AQ96EL1 285 aa15.03■□□□□ -0
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.02■□□□□ -0
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IER5LQ5T953 404 aa15□□□□□ -0.01
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SEC24BO95487 1268 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.95□□□□□ -0.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PYGBP11216 843 aa14.91□□□□□ -0.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO3Q9UK99 471 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VASPP50552 380 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PCDH10Q9P2E7 1040 aa14.81□□□□□ -0.04
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PLCG2P16885 1265 aa14.77□□□□□ -0.05
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.73□□□□□ -0.05
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 OCEL1Q9H607 264 aa14.72□□□□□ -0.05
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KLHL34Q8N239 644 aa14.7□□□□□ -0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GSE1Q14687 1217 aa14.69□□□□□ -0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ST18O60284 1047 aa14.67□□□□□ -0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.58□□□□□ -0.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PSEN1P49768 467 aa14.56□□□□□ -0.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPOCK2Q92563 424 aa14.51□□□□□ -0.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GOLGA2Q08379 1002 aa14.43□□□□□ -0.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.43□□□□□ -0.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.43□□□□□ -0.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.42□□□□□ -0.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SNPHO15079 494 aa14.4□□□□□ -0.1
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MARVELD3Q96A59 401 aa14.38□□□□□ -0.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 CABP2Q9NPB3 220 aa14.38□□□□□ -0.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.37□□□□□ -0.11
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POTEB3A0JP26 581 aa14.3□□□□□ -0.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 POTEBQ6S5H4 581 aa14.3□□□□□ -0.12
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.27□□□□□ -0.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.25□□□□□ -0.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.23□□□□□ -0.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MMRN1Q13201 1228 aa14.22□□□□□ -0.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.22□□□□□ -0.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TRIM41Q8WV44 630 aa14.21□□□□□ -0.13
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 EMP3P54852 163 aa14.2□□□□□ -0.14
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.19□□□□□ -0.14
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.18□□□□□ -0.14
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FAM205CA6NFA0 338 aa14.14□□□□□ -0.15
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 TMEM92Q6UXU6 159 aa14.13□□□□□ -0.15
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.12□□□□□ -0.15
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.09□□□□□ -0.15
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 G3V3G9 751 aa14.08□□□□□ -0.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.08□□□□□ -0.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 MICALL2Q8IY33 904 aa14.07□□□□□ -0.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 SOX12O15370 315 aa14.03□□□□□ -0.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 PHF8Q9UPP1 1060 aa14.03□□□□□ -0.16
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 DOK7Q18PE1 504 aa14□□□□□ -0.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ZNF710Q8N1W2 664 aa13.97□□□□□ -0.17
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.94□□□□□ -0.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 GPR153Q6NV75 609 aa13.91□□□□□ -0.18
CCDC39-AS1-201ENST00000495357 ERBB3P21860 1342 aa13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.8 ms