RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP12.02□□□□□ -0.49
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RABGGTB-209ENST00000473406 GSE1Q14687 1217 aa11.97□□□□□ -0.49
RABGGTB-209ENST00000473406 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
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RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-209ENST00000473406 HOMEZQ8IX15 550 aa11.67□□□□□ -0.54
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RABGGTB-209ENST00000473406 MFSD10Q14728 455 aa11.11□□□□□ -0.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 CCDC61Q9Y6R9 512 aa11.11□□□□□ -0.63
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RABGGTB-209ENST00000473406 CAMK2BQ13554 666 aa11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
RABGGTB-209ENST00000473406 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PDE4DQ08499 809 aa10.99□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 TRIM66O15016 1216 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.98□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 MAP3K13O43283 966 aa10.97□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
RABGGTB-209ENST00000473406 KIF12Q96FN5 646 aa10.94□□□□□ -0.66
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