RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460981.1

REV3L-208, Transcript of REV3 like, DNA directed polymerase zeta catalytic subunit, human

TSL 2

Gene REV3L, Length 441 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
REV3L-208	ENST00000460981	ASTL	Q6HA08	431 aa	Predicted RBP	14.88	□□□□□ -0.03
REV3L-208	ENST00000460981	RASEF	Q8IZ41	740 aa		14.86	□□□□□ -0.03
REV3L-208	ENST00000460981	KIF12	Q96FN5	646 aa		14.86	□□□□□ -0.03
REV3L-208	ENST00000460981	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	14.85	□□□□□ -0.03
REV3L-208	ENST00000460981	FKBP8	Q14318	412 aa		14.85	□□□□□ -0.03
REV3L-208	ENST00000460981	PLCD3	Q8N3E9	789 aa		14.84	□□□□□ -0.03
REV3L-208	ENST00000460981	OTUD5	Q96G74	571 aa		14.82	□□□□□ -0.04
REV3L-208	ENST00000460981	SLC39A7	Q92504	469 aa		14.77	□□□□□ -0.05
REV3L-208	ENST00000460981	METRN	Q9UJH8	293 aa		14.77	□□□□□ -0.05
REV3L-208	ENST00000460981	MAP3K13	O43283	966 aa		14.76	□□□□□ -0.05
REV3L-208	ENST00000460981	C7	P10643	843 aa		14.75	□□□□□ -0.05
REV3L-208	ENST00000460981	ATN1	P54259	1190 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
REV3L-208	ENST00000460981	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
REV3L-208	ENST00000460981	TRPC6	Q9Y210	931 aa		14.73	□□□□□ -0.05
REV3L-208	ENST00000460981	NUBP1	P53384	320 aa		14.71	□□□□□ -0.05
REV3L-208	ENST00000460981	BMP2K	Q9NSY1	1161 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
REV3L-208	ENST00000460981	POTEJ	P0CG39	1038 aa		14.66	□□□□□ -0.06
REV3L-208	ENST00000460981	TIE1	P35590	1138 aa		14.66	□□□□□ -0.06
REV3L-208	ENST00000460981	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		14.61	□□□□□ -0.07
REV3L-208	ENST00000460981	POTEF	A5A3E0	1075 aa		14.59	□□□□□ -0.07
REV3L-208	ENST00000460981	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		14.59	□□□□□ -0.07
REV3L-208	ENST00000460981	TTLL13P	A6NNM8	815 aa		14.58	□□□□□ -0.08
REV3L-208	ENST00000460981	FAM212A	Q96EL1	285 aa		14.58	□□□□□ -0.08
REV3L-208	ENST00000460981	FBXO3	Q9UK99	471 aa		14.56	□□□□□ -0.08
REV3L-208	ENST00000460981	MAMSTR	Q6ZN01	415 aa		14.55	□□□□□ -0.08
REV3L-208	ENST00000460981	IFNL1	Q8IU54	200 aa		14.52	□□□□□ -0.09
REV3L-208	ENST00000460981	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		14.48	□□□□□ -0.09
REV3L-208	ENST00000460981	COLQ	Q9Y215	455 aa	Predicted RBP	14.48	□□□□□ -0.09
REV3L-208	ENST00000460981	DCAF8	Q5TAQ9	597 aa		14.46	□□□□□ -0.09
REV3L-208	ENST00000460981	SCUBE2	Q9NQ36	999 aa		14.46	□□□□□ -0.09
REV3L-208	ENST00000460981	SEC24B	O95487	1268 aa		14.44	□□□□□ -0.1
REV3L-208	ENST00000460981	IER5L	Q5T953	404 aa		14.43	□□□□□ -0.1
REV3L-208	ENST00000460981	POTEM	A6NI47	508 aa		14.41	□□□□□ -0.1
REV3L-208	ENST00000460981	TMEM106C	Q9BVX2	250 aa		14.41	□□□□□ -0.1
REV3L-208	ENST00000460981	PYGB	P11216	843 aa		14.4	□□□□□ -0.1
REV3L-208	ENST00000460981	VASP	P50552	380 aa	Predicted RBP	14.39	□□□□□ -0.11
REV3L-208	ENST00000460981	POTEG	Q6S5H5	508 aa		14.39	□□□□□ -0.11
REV3L-208	ENST00000460981	KLHL34	Q8N239	644 aa		14.35	□□□□□ -0.11
REV3L-208	ENST00000460981	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		14.34	□□□□□ -0.11
REV3L-208	ENST00000460981	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	14.32	□□□□□ -0.12
REV3L-208	ENST00000460981	PCDHB8	Q9UN66	801 aa		14.31	□□□□□ -0.12
REV3L-208	ENST00000460981	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	14.3	□□□□□ -0.12
REV3L-208	ENST00000460981	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	14.27	□□□□□ -0.13
REV3L-208	ENST00000460981	GSE1	Q14687	1217 aa		14.27	□□□□□ -0.13
REV3L-208	ENST00000460981	PLCG2	P16885	1265 aa		14.26	□□□□□ -0.13
REV3L-208	ENST00000460981	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	14.19	□□□□□ -0.14
REV3L-208	ENST00000460981	OCEL1	Q9H607	264 aa		14.19	□□□□□ -0.14
REV3L-208	ENST00000460981	PCDH10	Q9P2E7	1040 aa		14.18	□□□□□ -0.14
REV3L-208	ENST00000460981	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		14.17	□□□□□ -0.14
REV3L-208	ENST00000460981	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	14.16	□□□□□ -0.14
REV3L-208	ENST00000460981	SPOCK2	Q92563	424 aa		14.11	□□□□□ -0.15
REV3L-208	ENST00000460981	PSEN1	P49768	467 aa		14.07	□□□□□ -0.16
REV3L-208	ENST00000460981	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	14.05	□□□□□ -0.16
REV3L-208	ENST00000460981	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	14.04	□□□□□ -0.16
REV3L-208	ENST00000460981	CIZ1	Q9ULV3	898 aa	Predicted RBP	14.04	□□□□□ -0.16
REV3L-208	ENST00000460981	ST18	O60284	1047 aa		14.03	□□□□□ -0.16
REV3L-208	ENST00000460981	GOLGA2	Q08379	1002 aa		14.03	□□□□□ -0.16
REV3L-208	ENST00000460981	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	14.02	□□□□□ -0.17
REV3L-208	ENST00000460981	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	14	□□□□□ -0.17
REV3L-208	ENST00000460981	BCLAF1	Q9NYF8	920 aa	Known RBP eCLIP	13.98	□□□□□ -0.17	2e-6	■■■□□ 14.8
REV3L-208	ENST00000460981	L3MBTL3	Q96JM7	780 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
REV3L-208	ENST00000460981	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.94	□□□□□ -0.18
REV3L-208	ENST00000460981	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
REV3L-208	ENST00000460981	SNPH	O15079	494 aa		13.91	□□□□□ -0.18
REV3L-208	ENST00000460981	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.9	□□□□□ -0.18
REV3L-208	ENST00000460981	CABP2	Q9NPB3	220 aa		13.9	□□□□□ -0.18
REV3L-208	ENST00000460981	DPY19L2	Q6NUT2	758 aa		13.87	□□□□□ -0.19
REV3L-208	ENST00000460981	TMEM121B	Q9BXQ6	578 aa	Predicted RBP	13.87	□□□□□ -0.19
REV3L-208	ENST00000460981	TRIM41	Q8WV44	630 aa		13.84	□□□□□ -0.19
REV3L-208	ENST00000460981	MARVELD3	Q96A59	401 aa		13.78	□□□□□ -0.2
REV3L-208	ENST00000460981	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		13.76	□□□□□ -0.21
REV3L-208	ENST00000460981	EFCAB3	Q8N7B9	438 aa		13.74	□□□□□ -0.21
REV3L-208	ENST00000460981		G3V3G9	751 aa		13.72	□□□□□ -0.21
REV3L-208	ENST00000460981	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
REV3L-208	ENST00000460981	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
REV3L-208	ENST00000460981	EMP3	P54852	163 aa		13.67	□□□□□ -0.22
REV3L-208	ENST00000460981	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	13.63	□□□□□ -0.23
REV3L-208	ENST00000460981	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
REV3L-208	ENST00000460981	ZFP91	Q96JP5	570 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
REV3L-208	ENST00000460981	VGF	O15240	615 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
REV3L-208	ENST00000460981	SPNS2	Q8IVW8	549 aa		13.61	□□□□□ -0.23
REV3L-208	ENST00000460981	POTEB3	A0JP26	581 aa		13.6	□□□□□ -0.23
REV3L-208	ENST00000460981	SOX12	O15370	315 aa		13.6	□□□□□ -0.23
REV3L-208	ENST00000460981	POTEB	Q6S5H4	581 aa		13.6	□□□□□ -0.23
REV3L-208	ENST00000460981	HS3ST6	Q96QI5	342 aa		13.59	□□□□□ -0.23
REV3L-208	ENST00000460981	FAM205C	A6NFA0	338 aa		13.58	□□□□□ -0.24
REV3L-208	ENST00000460981	MMRN1	Q13201	1228 aa		13.57	□□□□□ -0.24
REV3L-208	ENST00000460981	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.56	□□□□□ -0.24
REV3L-208	ENST00000460981	MS4A4A	Q96JQ5	239 aa		13.56	□□□□□ -0.24
REV3L-208	ENST00000460981	PHF8	Q9UPP1	1060 aa		13.54	□□□□□ -0.24
REV3L-208	ENST00000460981	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
REV3L-208	ENST00000460981	DOK7	Q18PE1	504 aa		13.52	□□□□□ -0.25
REV3L-208	ENST00000460981	TMEM92	Q6UXU6	159 aa		13.52	□□□□□ -0.25
REV3L-208	ENST00000460981	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		13.52	□□□□□ -0.25
REV3L-208	ENST00000460981	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		13.52	□□□□□ -0.25
REV3L-208	ENST00000460981	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		13.52	□□□□□ -0.25
REV3L-208	ENST00000460981	BCL11B	Q9C0K0	894 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
REV3L-208	ENST00000460981	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.44	□□□□□ -0.26
REV3L-208	ENST00000460981	RIMBP2	O15034	1052 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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