RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427861.2

TOMM20P4-201, Transcript of TOMM20 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene TOMM20P4, Length 435 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOMM20P4-201ENST00000427861 MS4A3Q96HJ5 214 aa7.93□□□□□ -1.14
TOMM20P4-201ENST00000427861 METRNQ9UJH8 293 aa7.92□□□□□ -1.14
TOMM20P4-201ENST00000427861 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
TOMM20P4-201ENST00000427861 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP7.9□□□□□ -1.14
TOMM20P4-201ENST00000427861 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
TOMM20P4-201ENST00000427861 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TOMM20P4-201ENST00000427861 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TOMM20P4-201ENST00000427861 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
TOMM20P4-201ENST00000427861 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
TOMM20P4-201ENST00000427861 C7P10643 843 aa7.86□□□□□ -1.15
TOMM20P4-201ENST00000427861 SLC39A7Q92504 469 aa7.86□□□□□ -1.15
TOMM20P4-201ENST00000427861 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
TOMM20P4-201ENST00000427861 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP7.84□□□□□ -1.15
TOMM20P4-201ENST00000427861 POTEFA5A3E0 1075 aa7.81□□□□□ -1.16
TOMM20P4-201ENST00000427861 PCDH10Q9P2E7 1040 aa7.81□□□□□ -1.16
TOMM20P4-201ENST00000427861 FBXO3Q9UK99 471 aa7.81□□□□□ -1.16
TOMM20P4-201ENST00000427861 TRPC6Q9Y210 931 aa7.81□□□□□ -1.16
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TOMM20P4-201ENST00000427861 CCDC61Q9Y6R9 512 aa7.77□□□□□ -1.17
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TOMM20P4-201ENST00000427861 KIF12Q96FN5 646 aa7.76□□□□□ -1.17
TOMM20P4-201ENST00000427861 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
TOMM20P4-201ENST00000427861 MAP3K13O43283 966 aa7.72□□□□□ -1.17
TOMM20P4-201ENST00000427861 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP7.72□□□□□ -1.17
TOMM20P4-201ENST00000427861 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
TOMM20P4-201ENST00000427861 CDAN1Q8IWY9 1227 aa7.69□□□□□ -1.18
TOMM20P4-201ENST00000427861 RASEFQ8IZ41 740 aa7.67□□□□□ -1.18
TOMM20P4-201ENST00000427861 SEC24BO95487 1268 aa7.66□□□□□ -1.18
TOMM20P4-201ENST00000427861 TIE1P35590 1138 aa7.66□□□□□ -1.18
TOMM20P4-201ENST00000427861 TTLL13PA6NNM8 815 aa7.65□□□□□ -1.18
TOMM20P4-201ENST00000427861 MIER1Q8N108 512 aa7.63□□□□□ -1.19
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TOMM20P4-201ENST00000427861 ST18O60284 1047 aa7.6□□□□□ -1.19
TOMM20P4-201ENST00000427861 SLAIN1Q8ND83 568 aa7.6□□□□□ -1.19
TOMM20P4-201ENST00000427861 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.57□□□□□ -1.2
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TOMM20P4-201ENST00000427861 PLEKHG5O94827 1062 aa7.54□□□□□ -1.2
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TOMM20P4-201ENST00000427861 IER5LQ5T953 404 aa7.53□□□□□ -1.2
TOMM20P4-201ENST00000427861 TMEM106CQ9BVX2 250 aa7.52□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 MMRN1Q13201 1228 aa7.51□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 NUBP1P53384 320 aa7.5□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.5□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 PLCD3Q8N3E9 789 aa7.5□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 SPOCK2Q92563 424 aa7.5□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 SGIP1Q9BQI5 828 aa7.5□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 PLCG2P16885 1265 aa7.49□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 MARVELD3Q96A59 401 aa7.48□□□□□ -1.21
TOMM20P4-201ENST00000427861 SLC24A1O60721 1099 aa7.44□□□□□ -1.22
TOMM20P4-201ENST00000427861 OCEL1Q9H607 264 aa7.41□□□□□ -1.22
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
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TOMM20P4-201ENST00000427861 PCDHB8Q9UN66 801 aa7.4□□□□□ -1.22
TOMM20P4-201ENST00000427861 FAM212AQ96EL1 285 aa7.39□□□□□ -1.23
TOMM20P4-201ENST00000427861 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
TOMM20P4-201ENST00000427861 POTEB3A0JP26 581 aa7.38□□□□□ -1.23
TOMM20P4-201ENST00000427861 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.38□□□□□ -1.23
TOMM20P4-201ENST00000427861 POTEBQ6S5H4 581 aa7.38□□□□□ -1.23
TOMM20P4-201ENST00000427861 KLHL34Q8N239 644 aa7.38□□□□□ -1.23
TOMM20P4-201ENST00000427861 SNPHO15079 494 aa7.37□□□□□ -1.23
TOMM20P4-201ENST00000427861 RGL2O15211 777 aa7.33□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 EMP3P54852 163 aa7.33□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 TRIM41Q8WV44 630 aa7.33□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.33□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.33□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 FAM205CA6NFA0 338 aa7.32□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 HS3ST6Q96QI5 342 aa7.31□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 PLCB2Q00722 1185 aa7.3□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa7.3□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 GSE1Q14687 1217 aa7.28□□□□□ -1.24
TOMM20P4-201ENST00000427861 C3orf67Q6ZVT6 689 aa7.28□□□□□ -1.24
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TOMM20P4-201ENST00000427861 DPY19L2Q6NUT2 758 aa7.25□□□□□ -1.25
TOMM20P4-201ENST00000427861 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
TOMM20P4-201ENST00000427861 GOLGA2Q08379 1002 aa7.24□□□□□ -1.25
TOMM20P4-201ENST00000427861 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
TOMM20P4-201ENST00000427861 HS6ST3Q8IZP7 471 aa7.23□□□□□ -1.25
TOMM20P4-201ENST00000427861 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
TOMM20P4-201ENST00000427861 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
TOMM20P4-201ENST00000427861 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
TOMM20P4-201ENST00000427861 PSEN1P49768 467 aa7.19□□□□□ -1.26
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
TOMM20P4-201ENST00000427861 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
TOMM20P4-201ENST00000427861 ERBB3P21860 1342 aa7.14□□□□□ -1.27
TOMM20P4-201ENST00000427861 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
TOMM20P4-201ENST00000427861 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TOMM20P4-201ENST00000427861 DCAF8L2P0C7V8 631 aa7.13□□□□□ -1.27
TOMM20P4-201ENST00000427861 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TOMM20P4-201ENST00000427861 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
TOMM20P4-201ENST00000427861 CABP2Q9NPB3 220 aa7.13□□□□□ -1.27
TOMM20P4-201ENST00000427861 ZNF710Q8N1W2 664 aa7.12□□□□□ -1.27
TOMM20P4-201ENST00000427861 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TOMM20P4-201ENST00000427861 BOLA1Q9Y3E2 137 aa7.12□□□□□ -1.27
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