RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419224.1

USP9YP20-201, Transcript of USP9Y pseudogene 20, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP20, Length 558 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP20-201ENST00000419224 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP13.42□□□□□ -0.26
USP9YP20-201ENST00000419224 MS4A3Q96HJ5 214 aa13.42□□□□□ -0.26
USP9YP20-201ENST00000419224 PCDH10Q9P2E7 1040 aa13.41□□□□□ -0.26
USP9YP20-201ENST00000419224 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
USP9YP20-201ENST00000419224 C7P10643 843 aa13.39□□□□□ -0.27
USP9YP20-201ENST00000419224 SLC39A7Q92504 469 aa13.38□□□□□ -0.27
USP9YP20-201ENST00000419224 MAMSTRQ6ZN01 415 aa13.31□□□□□ -0.28
USP9YP20-201ENST00000419224 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP13.26□□□□□ -0.29
USP9YP20-201ENST00000419224 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
USP9YP20-201ENST00000419224 POTEFA5A3E0 1075 aa13.24□□□□□ -0.29
USP9YP20-201ENST00000419224 CCDC61Q9Y6R9 512 aa13.23□□□□□ -0.29
USP9YP20-201ENST00000419224 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
USP9YP20-201ENST00000419224 SCUBE2Q9NQ36 999 aa13.2□□□□□ -0.3
USP9YP20-201ENST00000419224 KIF12Q96FN5 646 aa13.18□□□□□ -0.3
USP9YP20-201ENST00000419224 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP13.16□□□□□ -0.3
USP9YP20-201ENST00000419224 TRPC6Q9Y210 931 aa13.16□□□□□ -0.3
USP9YP20-201ENST00000419224 PROM2Q8N271 834 aa13.09□□□□□ -0.31
USP9YP20-201ENST00000419224 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
USP9YP20-201ENST00000419224 MAP3K13O43283 966 aa13.06□□□□□ -0.32
USP9YP20-201ENST00000419224 TIE1P35590 1138 aa13.05□□□□□ -0.32
USP9YP20-201ENST00000419224 CDAN1Q8IWY9 1227 aa13□□□□□ -0.33
USP9YP20-201ENST00000419224 TTLL13PA6NNM8 815 aa12.99□□□□□ -0.33
USP9YP20-201ENST00000419224 RASEFQ8IZ41 740 aa12.99□□□□□ -0.33
USP9YP20-201ENST00000419224 SEC24BO95487 1268 aa12.94□□□□□ -0.34
USP9YP20-201ENST00000419224 IER5LQ5T953 404 aa12.9□□□□□ -0.34
USP9YP20-201ENST00000419224 TRIM35Q9UPQ4 493 aa12.89□□□□□ -0.35
USP9YP20-201ENST00000419224 ST18O60284 1047 aa12.88□□□□□ -0.35
USP9YP20-201ENST00000419224 EHMT2Q96KQ7 1210 aa12.88□□□□□ -0.35
USP9YP20-201ENST00000419224 MIER1Q8N108 512 aa12.85□□□□□ -0.35
USP9YP20-201ENST00000419224 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.84□□□□□ -0.35
USP9YP20-201ENST00000419224 SGIP1Q9BQI5 828 aa12.84□□□□□ -0.35
USP9YP20-201ENST00000419224 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa12.81□□□□□ -0.36
USP9YP20-201ENST00000419224 PLEKHG5O94827 1062 aa12.78□□□□□ -0.36
USP9YP20-201ENST00000419224 IFNL1Q8IU54 200 aa12.77□□□□□ -0.37
USP9YP20-201ENST00000419224 NUBP1P53384 320 aa12.74□□□□□ -0.37
USP9YP20-201ENST00000419224 MMRN1Q13201 1228 aa12.74□□□□□ -0.37
USP9YP20-201ENST00000419224 SPNS2Q8IVW8 549 aa12.73□□□□□ -0.37
USP9YP20-201ENST00000419224 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP12.72□□□□□ -0.37
USP9YP20-201ENST00000419224 TMEM106CQ9BVX2 250 aa12.72□□□□□ -0.37
USP9YP20-201ENST00000419224 PLCG2P16885 1265 aa12.7□□□□□ -0.38
USP9YP20-201ENST00000419224 PLCD3Q8N3E9 789 aa12.65□□□□□ -0.38
USP9YP20-201ENST00000419224 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
USP9YP20-201ENST00000419224 MARVELD3Q96A59 401 aa12.6□□□□□ -0.39
USP9YP20-201ENST00000419224 OCEL1Q9H607 264 aa12.6□□□□□ -0.39
USP9YP20-201ENST00000419224 FAM212AQ96EL1 285 aa12.56□□□□□ -0.4
USP9YP20-201ENST00000419224 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP12.56□□□□□ -0.4
USP9YP20-201ENST00000419224 SNPHO15079 494 aa12.55□□□□□ -0.4
USP9YP20-201ENST00000419224 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP12.53□□□□□ -0.4
USP9YP20-201ENST00000419224 POTEB3A0JP26 581 aa12.47□□□□□ -0.41
USP9YP20-201ENST00000419224 POTEBQ6S5H4 581 aa12.47□□□□□ -0.41
USP9YP20-201ENST00000419224 PCDHB8Q9UN66 801 aa12.46□□□□□ -0.41
USP9YP20-201ENST00000419224 PYGBP11216 843 aa12.45□□□□□ -0.42
USP9YP20-201ENST00000419224 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
USP9YP20-201ENST00000419224 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa12.45□□□□□ -0.42
USP9YP20-201ENST00000419224 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa12.45□□□□□ -0.42
USP9YP20-201ENST00000419224 EMP3P54852 163 aa12.41□□□□□ -0.42
USP9YP20-201ENST00000419224 DCAF8Q5TAQ9 597 aa12.39□□□□□ -0.43
USP9YP20-201ENST00000419224 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.37□□□□□ -0.43
USP9YP20-201ENST00000419224 FAM205CA6NFA0 338 aa12.34□□□□□ -0.43
USP9YP20-201ENST00000419224 C3orf67Q6ZVT6 689 aa12.34□□□□□ -0.43
USP9YP20-201ENST00000419224 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
USP9YP20-201ENST00000419224 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP12.26□□□□□ -0.45
USP9YP20-201ENST00000419224 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP12.25□□□□□ -0.45
USP9YP20-201ENST00000419224 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP12.25□□□□□ -0.45
USP9YP20-201ENST00000419224 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
USP9YP20-201ENST00000419224 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
USP9YP20-201ENST00000419224 GOLGA2Q08379 1002 aa12.21□□□□□ -0.45
USP9YP20-201ENST00000419224 DPY19L2Q6NUT2 758 aa12.2□□□□□ -0.46
USP9YP20-201ENST00000419224 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP12.18□□□□□ -0.46
USP9YP20-201ENST00000419224 PSEN1P49768 467 aa12.18□□□□□ -0.46
USP9YP20-201ENST00000419224 FKBP8Q14318 412 aa12.16□□□□□ -0.46
USP9YP20-201ENST00000419224 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
USP9YP20-201ENST00000419224 GSE1Q14687 1217 aa12.13□□□□□ -0.47
USP9YP20-201ENST00000419224 BOLA1Q9Y3E2 137 aa12.09□□□□□ -0.47
USP9YP20-201ENST00000419224 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
USP9YP20-201ENST00000419224 ERBB3P21860 1342 aa12.06□□□□□ -0.48
USP9YP20-201ENST00000419224 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
USP9YP20-201ENST00000419224 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.03□□□□□ -0.48
USP9YP20-201ENST00000419224 FBXO3Q9UK99 471 aa12.03□□□□□ -0.48
USP9YP20-201ENST00000419224 CABP2Q9NPB3 220 aa12.02□□□□□ -0.49
USP9YP20-201ENST00000419224 DOK7Q18PE1 504 aa12.01□□□□□ -0.49
USP9YP20-201ENST00000419224 KLHL34Q8N239 644 aa12.01□□□□□ -0.49
USP9YP20-201ENST00000419224 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.99□□□□□ -0.49
USP9YP20-201ENST00000419224 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.99□□□□□ -0.49
USP9YP20-201ENST00000419224 VASPP50552 380 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
USP9YP20-201ENST00000419224 G3V3G9 751 aa11.97□□□□□ -0.49
USP9YP20-201ENST00000419224 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.93□□□□□ -0.5
USP9YP20-201ENST00000419224 TMEM92Q6UXU6 159 aa11.91□□□□□ -0.5
USP9YP20-201ENST00000419224 RIMBP2O15034 1052 aa11.89□□□□□ -0.51
USP9YP20-201ENST00000419224 GPR153Q6NV75 609 aa11.88□□□□□ -0.51
USP9YP20-201ENST00000419224 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.87□□□□□ -0.51
USP9YP20-201ENST00000419224 EFCAB3Q8N7B9 438 aa11.84□□□□□ -0.51
USP9YP20-201ENST00000419224 MICALL2Q8IY33 904 aa11.83□□□□□ -0.52
USP9YP20-201ENST00000419224 PTGER2P43116 358 aa11.82□□□□□ -0.52
USP9YP20-201ENST00000419224 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.79□□□□□ -0.52
USP9YP20-201ENST00000419224 SPOCK2Q92563 424 aa11.77□□□□□ -0.53
USP9YP20-201ENST00000419224 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.76□□□□□ -0.53
USP9YP20-201ENST00000419224 ARSIQ5FYB1 569 aa11.75□□□□□ -0.53
USP9YP20-201ENST00000419224 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
USP9YP20-201ENST00000419224 MS4A4AQ96JQ5 239 aa11.73□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms