RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410506.1

RNU6-1077P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1077, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-1077P, Length 102 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa5.2□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IGSF3O75054 1194 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 C1orf115Q9H7X2 142 aa5.18□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NECTIN2Q92692 538 aa5.17□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HS6ST3Q8IZP7 471 aa5.15□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ARID3CA6NKF2 412 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 P3H3Q8IVL6 736 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 SLC24A3Q9HC58 644 aa5.12□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KCTD17Q8N5Z5 321 aa5.11□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 APBB1O00213 710 aa5.1□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RAD21O60216 631 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLEKHG5O94827 1062 aa5.09□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP5.09□□□□□ -1.59
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CHMP4AQ9BY43 222 aa5.07□□□□□ -1.6
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RGS22Q8NE09 1264 aa5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KCNV2Q8TDN2 545 aa5.05□□□□□ -1.6
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MTMR7Q9Y216 660 aa5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1077P-201ENST00000410506 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP5.04□□□□□ -1.6
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RBM25P49756 843 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1077P-201ENST00000410506 IL27Q8NEV9 243 aa5.03□□□□□ -1.6
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLCD3Q8N3E9 789 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1077P-201ENST00000410506 CCDC82Q8N4S0 544 aa5.02□□□□□ -1.61
RNU6-1077P-201ENST00000410506 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF428Q96B54 188 aa5.01□□□□□ -1.61
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 TRIM41Q8WV44 630 aa5□□□□□ -1.61
RNU6-1077P-201ENST00000410506 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
RNU6-1077P-201ENST00000410506 WDR70Q9NW82 654 aa5□□□□□ -1.61
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 MIER1Q8N108 512 aa4.95□□□□□ -1.62
RNU6-1077P-201ENST00000410506 KDM4CQ9H3R0 1056 aa4.95□□□□□ -1.62
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 FLIIQ13045 1269 aa4.94□□□□□ -1.62
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 POLA2Q14181 598 aa4.93□□□□□ -1.62
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BARGINQ6ZT62 677 aa4.93□□□□□ -1.62
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 CADPS2Q86UW7 1296 aa4.92□□□□□ -1.62
RNU6-1077P-201ENST00000410506 AK7Q96M32 723 aa4.92□□□□□ -1.62
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 POLR3GLQ9BT43 218 aa4.91□□□□□ -1.62
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
RNU6-1077P-201ENST00000410506 RETREG2Q8NC44 543 aa4.88□□□□□ -1.63
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 SMYD5Q6GMV2 418 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1077P-201ENST00000410506 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa4.86□□□□□ -1.63
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 SERPINA10Q9UK55 444 aa4.86□□□□□ -1.63
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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RNU6-1077P-201ENST00000410506 GSE1Q14687 1217 aa4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1077P-201ENST00000410506 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
RNU6-1077P-201ENST00000410506 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.63
RNU6-1077P-201ENST00000410506 E2F4Q16254 413 aa4.83□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PLEKHG3A1L390 1219 aa4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
RNU6-1077P-201ENST00000410506 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
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