RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 MAMSTRQ6ZN01 415 aa15.41■□□□□ 0.06
CCL20-202ENST00000409189 MIER1Q8N108 512 aa15.41■□□□□ 0.06
CCL20-202ENST00000409189 PHF12Q96QT6 1004 aa15.41■□□□□ 0.06
CCL20-202ENST00000409189 PLEKHG5O94827 1062 aa15.38■□□□□ 0.05
CCL20-202ENST00000409189 CCDC61Q9Y6R9 512 aa15.31■□□□□ 0.04
CCL20-202ENST00000409189 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.3■□□□□ 0.04
CCL20-202ENST00000409189 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP15.28■□□□□ 0.04
CCL20-202ENST00000409189 SLC39A7Q92504 469 aa15.27■□□□□ 0.04
CCL20-202ENST00000409189 METRNQ9UJH8 293 aa15.27■□□□□ 0.04
CCL20-202ENST00000409189 C7P10643 843 aa15.26■□□□□ 0.03
CCL20-202ENST00000409189 RASEFQ8IZ41 740 aa15.26■□□□□ 0.03
CCL20-202ENST00000409189 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP15.24■□□□□ 0.03
CCL20-202ENST00000409189 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.23■□□□□ 0.03
CCL20-202ENST00000409189 SCUBE2Q9NQ36 999 aa15.23■□□□□ 0.03
CCL20-202ENST00000409189 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP15.22■□□□□ 0.03
CCL20-202ENST00000409189 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
CCL20-202ENST00000409189 FBXO3Q9UK99 471 aa15.22■□□□□ 0.03
CCL20-202ENST00000409189 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.03
CCL20-202ENST00000409189 NUBP1P53384 320 aa15.2■□□□□ 0.02
CCL20-202ENST00000409189 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
CCL20-202ENST00000409189 KIF12Q96FN5 646 aa15.19■□□□□ 0.02
CCL20-202ENST00000409189 POTEJP0CG39 1038 aa15.11■□□□□ 0.01
CCL20-202ENST00000409189 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
CCL20-202ENST00000409189 MAP3K13O43283 966 aa15.07■□□□□ 0
CCL20-202ENST00000409189 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
CCL20-202ENST00000409189 CDAN1Q8IWY9 1227 aa15.04■□□□□ -0
CCL20-202ENST00000409189 FAM212AQ96EL1 285 aa15.03■□□□□ -0
CCL20-202ENST00000409189 SGIP1Q9BQI5 828 aa15.02■□□□□ -0
CCL20-202ENST00000409189 TRPC6Q9Y210 931 aa15□□□□□ -0.01
CCL20-202ENST00000409189 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
CCL20-202ENST00000409189 TIE1P35590 1138 aa14.97□□□□□ -0.01
CCL20-202ENST00000409189 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
CCL20-202ENST00000409189 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL20-202ENST00000409189 ABCC9O60706 1549 aa14.92□□□□□ -0.02
CCL20-202ENST00000409189 TTLL13PA6NNM8 815 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL20-202ENST00000409189 IFNL1Q8IU54 200 aa14.88□□□□□ -0.03
CCL20-202ENST00000409189 DCAF8Q5TAQ9 597 aa14.86□□□□□ -0.03
CCL20-202ENST00000409189 KLHL34Q8N239 644 aa14.85□□□□□ -0.03
CCL20-202ENST00000409189 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
CCL20-202ENST00000409189 POTEFA5A3E0 1075 aa14.8□□□□□ -0.04
CCL20-202ENST00000409189 PYGBP11216 843 aa14.79□□□□□ -0.04
CCL20-202ENST00000409189 GSE1Q14687 1217 aa14.79□□□□□ -0.04
CCL20-202ENST00000409189 MMRN1Q13201 1228 aa14.77□□□□□ -0.05
CCL20-202ENST00000409189 TRIM35Q9UPQ4 493 aa14.76□□□□□ -0.05
CCL20-202ENST00000409189 IER5LQ5T953 404 aa14.74□□□□□ -0.05
CCL20-202ENST00000409189 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
CCL20-202ENST00000409189 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.72□□□□□ -0.05
CCL20-202ENST00000409189 SPOCK2Q92563 424 aa14.71□□□□□ -0.05
CCL20-202ENST00000409189 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CCL20-202ENST00000409189 SEC24BO95487 1268 aa14.68□□□□□ -0.06
CCL20-202ENST00000409189 SPNS2Q8IVW8 549 aa14.68□□□□□ -0.06
CCL20-202ENST00000409189 PCDHB8Q9UN66 801 aa14.68□□□□□ -0.06
CCL20-202ENST00000409189 ST18O60284 1047 aa14.65□□□□□ -0.06
CCL20-202ENST00000409189 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
CCL20-202ENST00000409189 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCL20-202ENST00000409189 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CCL20-202ENST00000409189 SLAIN1Q8ND83 568 aa14.57□□□□□ -0.08
CCL20-202ENST00000409189 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
CCL20-202ENST00000409189 PLCG2P16885 1265 aa14.5□□□□□ -0.09
CCL20-202ENST00000409189 PSEN1P49768 467 aa14.49□□□□□ -0.09
CCL20-202ENST00000409189 OCEL1Q9H607 264 aa14.48□□□□□ -0.09
CCL20-202ENST00000409189 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CCL20-202ENST00000409189 TRIM41Q8WV44 630 aa14.46□□□□□ -0.09
CCL20-202ENST00000409189 SNPHO15079 494 aa14.44□□□□□ -0.1
CCL20-202ENST00000409189 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP14.41□□□□□ -0.1
CCL20-202ENST00000409189 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.38□□□□□ -0.11
CCL20-202ENST00000409189 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.36□□□□□ -0.11
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA2Q08379 1002 aa14.35□□□□□ -0.11
CCL20-202ENST00000409189 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.29□□□□□ -0.12
CCL20-202ENST00000409189 CABP2Q9NPB3 220 aa14.29□□□□□ -0.12
CCL20-202ENST00000409189 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.29□□□□□ -0.12
CCL20-202ENST00000409189 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP14.24□□□□□ -0.13
CCL20-202ENST00000409189 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
CCL20-202ENST00000409189 MARVELD3Q96A59 401 aa14.23□□□□□ -0.13
CCL20-202ENST00000409189 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP14.23□□□□□ -0.13
CCL20-202ENST00000409189 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa14.18□□□□□ -0.14
CCL20-202ENST00000409189 VGFO15240 615 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
CCL20-202ENST00000409189 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.17□□□□□ -0.14
CCL20-202ENST00000409189 EMP3P54852 163 aa14.16□□□□□ -0.14
CCL20-202ENST00000409189 C3orf67Q6ZVT6 689 aa14.15□□□□□ -0.14
CCL20-202ENST00000409189 EFCAB3Q8N7B9 438 aa14.15□□□□□ -0.14
CCL20-202ENST00000409189 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CCL20-202ENST00000409189 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.14□□□□□ -0.15
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa14.11□□□□□ -0.15
CCL20-202ENST00000409189 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.11□□□□□ -0.15
CCL20-202ENST00000409189 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.09□□□□□ -0.15
CCL20-202ENST00000409189 SOX12O15370 315 aa14.06□□□□□ -0.16
CCL20-202ENST00000409189 PKD2Q13563 968 aa14.06□□□□□ -0.16
CCL20-202ENST00000409189 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.06□□□□□ -0.16
CCL20-202ENST00000409189 TAOK2Q9UL54 1235 aa14.03□□□□□ -0.16
CCL20-202ENST00000409189 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP14.02□□□□□ -0.17
CCL20-202ENST00000409189 MS4A4AQ96JQ5 239 aa14.02□□□□□ -0.17
CCL20-202ENST00000409189 G3V3G9 751 aa14□□□□□ -0.17
CCL20-202ENST00000409189 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP13.99□□□□□ -0.17
CCL20-202ENST00000409189 FAM205CA6NFA0 338 aa13.98□□□□□ -0.17
CCL20-202ENST00000409189 PHF8Q9UPP1 1060 aa13.98□□□□□ -0.17
CCL20-202ENST00000409189 RGL2O15211 777 aa13.95□□□□□ -0.18
CCL20-202ENST00000409189 MICALL2Q8IY33 904 aa13.95□□□□□ -0.18
CCL20-202ENST00000409189 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.93□□□□□ -0.18
CCL20-202ENST00000409189 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms