RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384154.1

RNU6-190P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 190, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-190P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-190P-201ENST00000384154 C7P10643 843 aa9.05□□□□□ -0.96
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLC39A7Q92504 469 aa9.03□□□□□ -0.96
RNU6-190P-201ENST00000384154 POTEJP0CG39 1038 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 KIF12Q96FN5 646 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 METRNQ9UJH8 293 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-190P-201ENST00000384154 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.96□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAMSTRQ6ZN01 415 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 POTEMA6NI47 508 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 TIE1P35590 1138 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 FKBP8Q14318 412 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 POTEFA5A3E0 1075 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 RASEFQ8IZ41 740 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP8.92□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 SGIP1Q9BQI5 828 aa8.91□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 MAP3K13O43283 966 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLEKHG5O94827 1062 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDH10Q9P2E7 1040 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-190P-201ENST00000384154 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
RNU6-190P-201ENST00000384154 POTEGQ6S5H5 508 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRPC6Q9Y210 931 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-190P-201ENST00000384154 MIER1Q8N108 512 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLSCR2Q9NRY7 297 aa8.87□□□□□ -0.99
RNU6-190P-201ENST00000384154 NUBP1P53384 320 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-190P-201ENST00000384154 TTLL13PA6NNM8 815 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-190P-201ENST00000384154 IER5LQ5T953 404 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-190P-201ENST00000384154 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.84□□□□□ -0.99
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
RNU6-190P-201ENST00000384154 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.8□□□□□ -1
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLCD3Q8N3E9 789 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-190P-201ENST00000384154 IFNL1Q8IU54 200 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRIM35Q9UPQ4 493 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-190P-201ENST00000384154 SEC24BO95487 1268 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM212AQ96EL1 285 aa8.72□□□□□ -1.01
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
RNU6-190P-201ENST00000384154 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM106CQ9BVX2 250 aa8.67□□□□□ -1.02
RNU6-190P-201ENST00000384154 OCEL1Q9H607 264 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-190P-201ENST00000384154 FBXO3Q9UK99 471 aa8.61□□□□□ -1.03
RNU6-190P-201ENST00000384154 PLCG2P16885 1265 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-190P-201ENST00000384154 SLAIN1Q8ND83 568 aa8.6□□□□□ -1.03
RNU6-190P-201ENST00000384154 ST18O60284 1047 aa8.59□□□□□ -1.03
RNU6-190P-201ENST00000384154 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RNU6-190P-201ENST00000384154 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.57□□□□□ -1.04
RNU6-190P-201ENST00000384154 PYGBP11216 843 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-190P-201ENST00000384154 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-190P-201ENST00000384154 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.56□□□□□ -1.04
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RNU6-190P-201ENST00000384154 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RNU6-190P-201ENST00000384154 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.54□□□□□ -1.04
RNU6-190P-201ENST00000384154 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RNU6-190P-201ENST00000384154 GSE1Q14687 1217 aa8.52□□□□□ -1.05
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-190P-201ENST00000384154 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RNU6-190P-201ENST00000384154 SNPHO15079 494 aa8.5□□□□□ -1.05
RNU6-190P-201ENST00000384154 VASPP50552 380 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
RNU6-190P-201ENST00000384154 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
RNU6-190P-201ENST00000384154 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
RNU6-190P-201ENST00000384154 PSEN1P49768 467 aa8.41□□□□□ -1.06
RNU6-190P-201ENST00000384154 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPNS2Q8IVW8 549 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-190P-201ENST00000384154 KLHL34Q8N239 644 aa8.4□□□□□ -1.06
RNU6-190P-201ENST00000384154 MMRN1Q13201 1228 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-190P-201ENST00000384154 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
RNU6-190P-201ENST00000384154 C3orf67Q6ZVT6 689 aa8.38□□□□□ -1.07
RNU6-190P-201ENST00000384154 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
RNU6-190P-201ENST00000384154 GOLGA2Q08379 1002 aa8.37□□□□□ -1.07
RNU6-190P-201ENST00000384154 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
RNU6-190P-201ENST00000384154 MARVELD3Q96A59 401 aa8.35□□□□□ -1.07
RNU6-190P-201ENST00000384154 SPOCK2Q92563 424 aa8.33□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 POTEB3A0JP26 581 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 POTEBQ6S5H4 581 aa8.32□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 EMP3P54852 163 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 DPY19L2Q6NUT2 758 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.31□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 BOLA1Q9Y3E2 137 aa8.29□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 HS3ST6Q96QI5 342 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 CABP2Q9NPB3 220 aa8.28□□□□□ -1.08
RNU6-190P-201ENST00000384154 TRIM41Q8WV44 630 aa8.27□□□□□ -1.09
RNU6-190P-201ENST00000384154 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.25□□□□□ -1.09
RNU6-190P-201ENST00000384154 FAM205CA6NFA0 338 aa8.22□□□□□ -1.09
RNU6-190P-201ENST00000384154 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
RNU6-190P-201ENST00000384154 DOK7Q18PE1 504 aa8.2□□□□□ -1.1
RNU6-190P-201ENST00000384154 G3V3G9 751 aa8.19□□□□□ -1.1
RNU6-190P-201ENST00000384154 EFCAB3Q8N7B9 438 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.18□□□□□ -1.1
RNU6-190P-201ENST00000384154 SOX12O15370 315 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-190P-201ENST00000384154 PKD2Q13563 968 aa8.16□□□□□ -1.1
RNU6-190P-201ENST00000384154 TMEM92Q6UXU6 159 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-190P-201ENST00000384154 MICALL2Q8IY33 904 aa8.15□□□□□ -1.1
RNU6-190P-201ENST00000384154 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.14□□□□□ -1.11
RNU6-190P-201ENST00000384154 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RNU6-190P-201ENST00000384154 MS4A4AQ96JQ5 239 aa8.13□□□□□ -1.11
RNU6-190P-201ENST00000384154 RIMBP2O15034 1052 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-190P-201ENST00000384154 GPR153Q6NV75 609 aa8.12□□□□□ -1.11
RNU6-190P-201ENST00000384154 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RNU6-190P-201ENST00000384154 ERBB3P21860 1342 aa8.1□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.8 ms