RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366959.4

RPS6KC1-201, Transcript of ribosomal protein S6 kinase C1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 2 BASIC

Gene RPS6KC1, Length 5,454 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RPS6KC1-201ENST00000366959 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
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RPS6KC1-201ENST00000366959 FHAD1B1AJZ9 1412 aa18.41■□□□□ 0.54
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RPS6KC1-201ENST00000366959 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.41■□□□□ 0.54
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RPS6KC1-201ENST00000366959 PKD2Q13563 968 aa18.4■□□□□ 0.54
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RPS6KC1-201ENST00000366959 VPS8Q8N3P4 1428 aa18.39■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 NACADO15069 1562 aa18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 CCDC88BA6NC98 1476 aa18.37■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 MLECQ14165 292 aa18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.36■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa18.35■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 MORC1Q86VD1 984 aa18.33■□□□□ 0.53
RPS6KC1-201ENST00000366959 STK26Q9P289 416 aa18.32■□□□□ 0.52
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