RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263054.10

SORCS1-201, Transcript of sortilin related VPS10 domain containing receptor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SORCS1, Length 7,272 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS1-201ENST00000263054 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP19.28■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 CSRNP3Q8WYN3 585 aa19.27■□□□□ 0.68
SORCS1-201ENST00000263054 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP19.25■□□□□ 0.67
SORCS1-201ENST00000263054 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP19.23■□□□□ 0.67
SORCS1-201ENST00000263054 LMOD2Q6P5Q4 547 aa19.22■□□□□ 0.67
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP19.22■□□□□ 0.67
SORCS1-201ENST00000263054 RGL3Q3MIN7 710 aa19.21■□□□□ 0.67
SORCS1-201ENST00000263054 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.2■□□□□ 0.66
SORCS1-201ENST00000263054 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.19■□□□□ 0.66
SORCS1-201ENST00000263054 NPHP1O15259 732 aa19.17■□□□□ 0.66
SORCS1-201ENST00000263054 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa19.17■□□□□ 0.66
SORCS1-201ENST00000263054 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP19.16■□□□□ 0.66
SORCS1-201ENST00000263054 MRS2Q9HD23 443 aa19.16■□□□□ 0.66
SORCS1-201ENST00000263054 TSPY4P0CV99 314 aa19.11■□□□□ 0.65
SORCS1-201ENST00000263054 TSPY10P0CW01 314 aa19.11■□□□□ 0.65
SORCS1-201ENST00000263054 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.11■□□□□ 0.65
SORCS1-201ENST00000263054 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP19.08■□□□□ 0.65
SORCS1-201ENST00000263054 NEUROD2Q15784 382 aa19.08■□□□□ 0.64
SORCS1-201ENST00000263054 SOX12O15370 315 aa19.03■□□□□ 0.64
SORCS1-201ENST00000263054 MTUS2Q5JR59 1369 aa19.01■□□□□ 0.63
SORCS1-201ENST00000263054 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
SORCS1-201ENST00000263054 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SORCS1-201ENST00000263054 TRHP20396 242 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
SORCS1-201ENST00000263054 MIER1Q8N108 512 aa18.93■□□□□ 0.62
SORCS1-201ENST00000263054 MLECQ14165 292 aa18.93■□□□□ 0.62
SORCS1-201ENST00000263054 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
SORCS1-201ENST00000263054 PLCB2Q00722 1185 aa18.92■□□□□ 0.62
SORCS1-201ENST00000263054 CLSTN1O94985 981 aa18.9■□□□□ 0.62
SORCS1-201ENST00000263054 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa18.86■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP18.85■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 POGKQ9P215 609 aa18.84■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA2Q08379 1002 aa18.83■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP18.83■□□□□ 0.61
SORCS1-201ENST00000263054 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 BECN1Q14457 450 aa18.82■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 CASC1Q6TDU7 716 aa18.81■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 KNSTRNQ9Y448 316 aa18.81■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 RGS3P49796 1198 aa18.79■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 FGD1P98174 961 aa18.78■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP18.78■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 CFAP53Q96M91 514 aa18.78■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa18.78■□□□□ 0.6
SORCS1-201ENST00000263054 PLEKHD1A6NEE1 506 aa18.76■□□□□ 0.59
SORCS1-201ENST00000263054 KCNJ4P48050 445 aa18.75■□□□□ 0.59
SORCS1-201ENST00000263054 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa18.74■□□□□ 0.59
SORCS1-201ENST00000263054 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP18.74■□□□□ 0.59
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA6L22H0YM25 854 aa18.74■□□□□ 0.59
SORCS1-201ENST00000263054 CARD11Q9BXL7 1154 aa18.74■□□□□ 0.59
SORCS1-201ENST00000263054 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP18.72■□□□□ 0.59
SORCS1-201ENST00000263054 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP18.7■□□□□ 0.58
SORCS1-201ENST00000263054 DDRGK1Q96HY6 314 aa18.7■□□□□ 0.58
SORCS1-201ENST00000263054 APBB1O00213 710 aa18.68■□□□□ 0.58
SORCS1-201ENST00000263054 STK26Q9P289 416 aa18.68■□□□□ 0.58
SORCS1-201ENST00000263054 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP18.68■□□□□ 0.58
SORCS1-201ENST00000263054 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SORCS1-201ENST00000263054 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SORCS1-201ENST00000263054 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP18.67■□□□□ 0.58
SORCS1-201ENST00000263054 ERCC6Q03468 1493 aa18.67■□□□□ 0.58
SORCS1-201ENST00000263054 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP18.62■□□□□ 0.57
SORCS1-201ENST00000263054 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP18.62■□□□□ 0.57
SORCS1-201ENST00000263054 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP18.61■□□□□ 0.57
SORCS1-201ENST00000263054 SIN3AQ96ST3 1273 aa18.61■□□□□ 0.57
SORCS1-201ENST00000263054 CLIP1P30622 1438 aa18.61■□□□□ 0.57
SORCS1-201ENST00000263054 ERICH6BQ5W0A0 696 aa18.6■□□□□ 0.57
SORCS1-201ENST00000263054 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
SORCS1-201ENST00000263054 PDE4CQ08493 712 aa18.58■□□□□ 0.56
SORCS1-201ENST00000263054 NUDCQ9Y266 331 aa18.57■□□□□ 0.56
SORCS1-201ENST00000263054 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa18.55■□□□□ 0.56
SORCS1-201ENST00000263054 DCAF11Q8TEB1 546 aa18.54■□□□□ 0.56
SORCS1-201ENST00000263054 CDCA8Q53HL2 280 aa18.52■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 DRC7Q8IY82 874 aa18.52■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 PRM3Q9NNZ6 103 aa18.51■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 ARID3AQ99856 593 aa18.51■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP18.49■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 GGT6Q6P531 493 aa18.49■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa18.49■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa18.48■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 FOXD1Q16676 465 aa18.48■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 CHMP3Q9Y3E7 222 aa18.48■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SORCS1-201ENST00000263054 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa18.44■□□□□ 0.54
SORCS1-201ENST00000263054 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa18.44■□□□□ 0.54
SORCS1-201ENST00000263054 NUTM2FA1L443 756 aa18.43■□□□□ 0.54
SORCS1-201ENST00000263054 MORC1Q86VD1 984 aa18.41■□□□□ 0.54
SORCS1-201ENST00000263054 MYO15BQ96JP2 1530 aa18.4■□□□□ 0.54
SORCS1-201ENST00000263054 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.39■□□□□ 0.54
SORCS1-201ENST00000263054 CEP162Q5TB80 1403 aa18.38■□□□□ 0.53
SORCS1-201ENST00000263054 CREBRFQ8IUR6 639 aa18.38■□□□□ 0.53
SORCS1-201ENST00000263054 HSCBQ8IWL3 235 aa18.38■□□□□ 0.53
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