RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RALGPS1-201ENST00000259351 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
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RALGPS1-201ENST00000259351 CEP162Q5TB80 1403 aa17.13■□□□□ 0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 KCNH8Q96L42 1107 aa17.12■□□□□ 0.33
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RALGPS1-201ENST00000259351 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP16.77■□□□□ 0.27
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RALGPS1-201ENST00000259351 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RALGPS1-201ENST00000259351 CASC1Q6TDU7 716 aa16.68■□□□□ 0.26
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RALGPS1-201ENST00000259351 CECR2Q9BXF3 1484 aa16.66■□□□□ 0.26
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RALGPS1-201ENST00000259351 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP16.65■□□□□ 0.26
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RALGPS1-201ENST00000259351 TMF1P82094 1093 aa16.64■□□□□ 0.26
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RALGPS1-201ENST00000259351 CUX2O14529 1486 aa16.59■□□□□ 0.25
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RALGPS1-201ENST00000259351 SETD5Q9C0A6 1442 aa16.57■□□□□ 0.24
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RALGPS1-201ENST00000259351 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa16.55■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 KCNJ4P48050 445 aa16.54■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 FGD1P98174 961 aa16.54■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.53■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 MS4A1P11836 297 aa16.53■□□□□ 0.24
RALGPS1-201ENST00000259351 STK26Q9P289 416 aa16.53■□□□□ 0.24
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RALGPS1-201ENST00000259351 GGT6Q6P531 493 aa16.51■□□□□ 0.23
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