RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439415.1

CBX1P4-201, Transcript of chromobox 1 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene CBX1P4, Length 457 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1P4-201ENST00000439415 LY6EQ16553 131 aa2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 VSTM2AQ8TAG5 236 aa2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 BRK1Q8WUW1 75 aa2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00167Q96N53 147 aa2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PLXNB1O43157 2135 aa2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 DSPPQ9NZW4 1301 aa2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 MTORP42345 2549 aa2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 MED13LQ71F56 2210 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 VPS13CQ709C8 3753 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PNM2 257 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 RTL8CO15255 209 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PITX3O75364 302 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 CST7O76096 145 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PROSCO94903 275 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 DYNLT3P51808 116 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 LSM3P62310 102 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 SEC11AP67812 179 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 MSMO1Q15800 293 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 ADIRFQ15847 76 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 FAM27BQ5VT28 67 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 DPPA3Q6W0C5 159 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 C3orf56Q8N813 242 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 OR2T10Q8NGZ9 312 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 OR10AC1Q8NH08 325 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 SPCS1Q9Y6A9 102 aa2.62□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 MED13Q9UHV7 2174 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 NBASA2RRP1 2371 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 TRPM6Q9BX84 2022 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 MUC21A0A140T8X8 626 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 C3orf85A0A1B0GTC6 90 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1B0GVY2 172 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A1W2PPM0 123 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 TCRAP04437 139 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 COX6A1P12074 109 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFA4P12838 97 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 RPL22P35268 128 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 QRFPP83859 136 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 ZNF345Q14585 488 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 Q56UQ5 140 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 LCE1EQ5T753 118 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 OR10AG1Q8NH19 301 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PRELID3AQ96N28 172 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 AQP10Q96PS8 301 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 NAA60Q9H7X0 242 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa2.61□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 MYO16Q9Y6X6 1858 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 APCP25054 2843 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 ABCA2Q9BZC7 2435 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 RBAKDNA6NC62 111 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 ODF3BA8MYP8 253 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 NDUFB3O43676 98 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 IGKV3-11P04433 115 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PYYP10082 97 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 SDC2P34741 201 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 ASIPP42127 132 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 IGFBP7Q16270 282 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PRR9Q5T870 116 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 DEFB107AQ8IZN7 70 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 NPCDR1Q9BY65 106 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 RYR3Q15413 4870 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 CEP192Q8TEP8 1941 aa2.6□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 SDK2Q58EX2 2172 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 KNTC1P50748 2209 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 A0A0G2JND7 137 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 A8MWV9 139 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 CCL16O15467 120 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 TRACP01848 142 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 CD3DP04234 171 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 LINC00305Q7Z4B0 112 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 C18orf32Q8TCD1 76 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 RAB37Q96AX2 223 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 PRO0461Q9UI25 63 aa2.59□□□□□ -1.99
CBX1P4-201ENST00000439415 ANK2Q01484 3957 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BMG7 143 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 H3BUT2 72 aa2.58□□□□□ -2
CBX1P4-201ENST00000439415 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa2.58□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.7 ms