RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365336.1

RNU6-169P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 169, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-169P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-169P-201ENST00000365336 RPS28P62857 69 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP-0.74□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 TGP01266 2768 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 A0A1B0GX51 115 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 DDA1Q9BW61 102 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 ACANP16112 2415 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 FAT2Q9NYQ8 4349 aa-0.75□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 G3V318 75 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 M0R2P5 195 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 TNFSF15O95150 251 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 EDDM3BP56851 147 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 HIGD1AQ9Y241 93 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 ERCC6Q03468 1493 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 PLXNA1Q9UIW2 1896 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 FAM208BQ5VWN6 2430 aa-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.76□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 AKAP6Q13023 2319 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 NRXN2Q9P2S2 1712 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 TRAV22A0A0B4J277 110 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 SCTP09683 121 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 NDUFA12Q9UI09 145 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 HSPB11Q9Y547 144 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 Q5VSD8 79 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 LINC01545Q5VT33 79 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 GINS2Q9Y248 185 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 SPTBN2O15020 2390 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-169P-201ENST00000365336 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 SPAG11BQ08648 103 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 ZNF292O60281 2723 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 MYO18BQ8IUG5 2567 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 PIN1P1O15428 100 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 PRM1P04553 51 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 SPANXN1Q5VSR9 72 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 FAM92AA1XBS5 289 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 NCS1P62166 190 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 CCDC153Q494R4 210 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 VSTM2AQ8TAG5 236 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 C10orf82Q8WW14 230 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 RPRMQ9NS64 109 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 ALMS1Q8TCU4 4167 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 SMIM6P0DI80 62 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 Q8IZM0 81 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 SPANXCQ9NY87 97 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 AKAP11Q9UKA4 1901 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 SYNJ1O43426 1573 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 A6NIN4 97 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 UBE2D1P51668 147 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 SELENOSQ9BQE4 189 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 SPCS1Q9Y6A9 102 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 ZNF609O15014 1411 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 BPTFQ12830 3046 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 M0R129 80 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 IFNA17P01571 189 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 PIRTP0C851 137 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 SPRR1AP35321 89 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 MIC13Q5XKP0 118 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 NPVFQ9HCQ7 196 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 PKDREJQ9NTG1 2253 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 NF1P21359 2839 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa-0.85□□□□□ -2.54
RNU6-169P-201ENST00000365336 LAMA3Q16787 3333 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 NPFFO15130 113 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 DBIP07108 87 aaKnown RBP-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 CFAP126Q5VTH2 177 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 Q5VV11 94 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 CTAGE3PQ8IX95 158 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 SAR1AQ9NR31 198 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 EPG5Q9HCE0 2579 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 PDZD2O15018 2839 aa-0.85□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.86□□□□□ -2.55
RNU6-169P-201ENST00000365336 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.86□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 171.2 ms