RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479490.1

SFT2D1-203, Transcript of SFT2 domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SFT2D1, Length 2,061 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D1-203ENST00000479490 ZFP2Q6ZN57 461 aa8.57□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 Q6ZS46 218 aa8.57□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 CRYGDP07320 174 aa8.56□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 CD7P09564 240 aa8.56□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 PMVKQ15126 192 aa8.56□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa8.56□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 DCANP1Q8TF63 244 aa8.56□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 TMEM141Q96I45 108 aa8.56□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 FBN2P35556 2912 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 IGIPA6NJ69 53 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 C11orf86A6NJI1 115 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 F5H697 171 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 VCYO14598 125 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 TSHBP01222 138 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 EDN2P20800 178 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 GAGE13Q4V321 117 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 AMTNQ6UX39 209 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 PLEKHB2Q96CS7 222 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 TIMM17AQ99595 171 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 SVEP1Q4LDE5 3571 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 CENPEQ02224 2701 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 A0A087WWL8 130 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 MSMBP08118 114 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 MORN3Q6PF18 240 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 ODF3Q96PU9 254 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 JPT2Q9H910 190 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 SPG11Q96JI7 2443 aa8.55□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 SDHAF1A6NFY7 115 aa8.54□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 LGALS9O00182 355 aa8.54□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 NRGNQ92686 78 aa8.54□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 TMEM238C9JI98 176 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 KRTAP10-9P60411 292 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 RPL39P62891 51 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 SYT8Q8NBV8 401 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 ZNF580Q9UK33 172 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 UBE2D1P51668 147 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 EMP1P54849 157 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 ATP5J2P56134 94 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 ETDBQ3ZM63 59 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 FAM74A4Q5TZK3 123 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 C9orf85Q96MD7 179 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 PRO0461Q9UI25 63 aa8.53□□□□□ -1.04
SFT2D1-203ENST00000479490 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 ABCA12Q86UK0 2595 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 ZNF688P0C7X2 276 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 PSMB8P28062 276 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 ZNF56Q15929 161 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 TMEM95Q3KNT9 176 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 TMEM170BQ5T4T1 132 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 SH2D6Q7Z4S9 175 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 MTURNQ8N3F0 131 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 A0A0J9YX75 114 aa8.51□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 A0A0J9YY99 117 aa8.51□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.51□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 MED13LQ71F56 2210 aa8.51□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 TSPAN13O95857 204 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 RHOHQ15669 191 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 ZNF876PQ49A33 203 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 ABCA2Q9BZC7 2435 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 B4DSR2 109 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 SIGMAR1Q99720 223 aa8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 SPAG8Q99932 426 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 ZFHX3Q15911 3703 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 POLQO75417 2590 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 M0QY20 66 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 APOMO95445 188 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 IGKV3-20P01619 116 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 SCGB1A1P11684 91 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 TSPEAR-AS2P59090 65 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 Q8N1Y9 231 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 ZNRF2Q8NHG8 242 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 SPATA25Q9BR10 227 aa8.49□□□□□ -1.05
SFT2D1-203ENST00000479490 GTSF1LQ9H1H1 148 aa8.49□□□□□ -1.05
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