RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004097.15

Cux1-201, Transcript of Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cux1, Length 12,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm94Q3V2D2 93 aa6.97□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mrpl36Q99N90 102 aa6.97□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Aurkaip1Q9DCJ7 200 aa6.97□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nit2Q9JHW2 276 aa6.97□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Med13lQ6JPI3 2207 aa6.97□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm13083A2AGW5 501 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ifna11Q61716 190 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Hdgfl3Q9JMG7 202 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 AgmatA2AS89 358 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Prss32E9Q409 334 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ceacam12Q3UKP4 300 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fam220aQ3ZN08 260 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Atg4dQ8BGV9 474 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem140Q8BGY5 185 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Psme4Q5SSW2 1843 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Marf1Q8BJ34 1730 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ubr3Q5U430 1889 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Klf1P46099 358 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm904Q3V2L5 102 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Msrb2Q78J03 175 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zfp420Q7TMN8 578 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mbnl2Q8C181 373 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Anapc16Q9CPV2 110 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Bdp1Q571C7 2467 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zfp764E9QAP1 431 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 MgllO35678 303 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Znf260Q62513 407 aa6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ndufv3Q8BK30 104 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pqlc2Q8C4N4 293 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1258Q8VGN6 311 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Siglec15A7E1W8 342 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm9772F6XPD8 135 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pcp2P12660 120 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 AsipQ03288 131 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr904Q7TRC9 310 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Srsf7Q8BL97 267 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Myo5aQ99104 1853 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Col6a4A2AX52 2309 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ighv1-15A0A0A6YXA5 117 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr556E9Q549 324 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ndufa11Q9D8B4 141 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rab24P35290 203 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zpld1Q8BGZ8 415 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 1700001C19RikQ8K168 210 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Scrt1Q99M85 348 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 PyyQ9EPS2 98 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Crlf1Q9JM58 425 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kcne3Q9WTW2 103 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Igkv4-90A0A075B5L3 117 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Atp4bP50992 294 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ifi27Q8C6G0 260 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 AcacaQ5SWU9 2345 aa6.96□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 A6H6Q4 206 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dnase2P56542 353 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 ClppO88696 272 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 GastP48757 101 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm17334Q8C6U3 126 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 BivmQ8CBX9 502 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr968Q8VFN4 314 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Loxl4Q924C6 757 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rnf217D3YYI7 515 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1173Q7TR24 312 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1012Q8VFJ7 311 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmeff2Q9QYM9 374 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pkd1l3Q2EG98 2201 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Igkv4-69A0A0B4J1I6 116 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 KncnQ307W7 124 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Anapc10Q8K2H6 185 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Iah1Q9DB29 249 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm10073E9Q3T0 114 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Wnt2P21552 360 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Edn3P48299 214 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr498Q8VEW2 330 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem189Q99LQ7 271 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm12845A0A0N4SUM5 588 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm17430F6RSK3 157 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Prss12O08762 761 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rab29Q91YQ1 204 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sgms2Q9D4B1 365 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1191-ps1A0A1L1STD5 311 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Eid2bE9Q2Y0 151 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm2381G3UY53 305 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 P01802 115 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 ElaneQ3UP87 265 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Il24Q925S4 181 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gpr132Q9Z282 382 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Frem1Q684R7 2191 aa6.95□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Alx4O35137 399 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 CntfrO88507 372 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lrp10Q7TQH7 713 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cox7a1P56392 80 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Psg27Q497W2 474 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pttg1Q9CQJ7 199 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Trav2Q5R1I9 109 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Igkv4-63A0A0G2JFU6 117 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zdhhc22A0PK84 263 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lamtor3O88653 124 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tmem127Q8BGP5 238 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Malrd1A2AJX4 2123 aa6.94□□□□□ -1.3
Cux1-201ENSMUST00000004097 Spink14B9EJP9 96 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 82.4 ms