Protein–RNA interactions for Protein: Q99104

Myo5a, Unconventional myosin-Va, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,853 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5aQ99104 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
Myo5aQ99104 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
Myo5aQ99104 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
Myo5aQ99104 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
Myo5aQ99104 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Myo5aQ99104 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC36.2■■■■□ 3.39
Myo5aQ99104 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
Myo5aQ99104 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
Myo5aQ99104 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Myo5aQ99104 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Myo5aQ99104 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Myo5aQ99104 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Myo5aQ99104 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Myo5aQ99104 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Myo5aQ99104 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Myo5aQ99104 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
Myo5aQ99104 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Myo5aQ99104 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Myo5aQ99104 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Myo5aQ99104 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Myo5aQ99104 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Myo5aQ99104 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Myo5aQ99104 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Myo5aQ99104 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Myo5aQ99104 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
Myo5aQ99104 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
Myo5aQ99104 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Myo5aQ99104 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
Myo5aQ99104 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Myo5aQ99104 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Myo5aQ99104 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Myo5aQ99104 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Myo5aQ99104 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
Myo5aQ99104 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Myo5aQ99104 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Myo5aQ99104 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
Myo5aQ99104 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Myo5aQ99104 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Myo5aQ99104 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Myo5aQ99104 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Myo5aQ99104 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Myo5aQ99104 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Myo5aQ99104 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Myo5aQ99104 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo5aQ99104 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Myo5aQ99104 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Myo5aQ99104 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Myo5aQ99104 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Myo5aQ99104 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Myo5aQ99104 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Myo5aQ99104 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
Myo5aQ99104 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Myo5aQ99104 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Myo5aQ99104 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Myo5aQ99104 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Myo5aQ99104 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Myo5aQ99104 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
Myo5aQ99104 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myo5aQ99104 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Myo5aQ99104 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Myo5aQ99104 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Myo5aQ99104 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
Myo5aQ99104 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.6■■■□□ 2.65
Myo5aQ99104 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Myo5aQ99104 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
Myo5aQ99104 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
Myo5aQ99104 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
Myo5aQ99104 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
Myo5aQ99104 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
Myo5aQ99104 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
Myo5aQ99104 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Myo5aQ99104 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
Myo5aQ99104 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
Myo5aQ99104 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Myo5aQ99104 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
Myo5aQ99104 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5aQ99104 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Myo5aQ99104 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Myo5aQ99104 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Myo5aQ99104 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo5aQ99104 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5aQ99104 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5aQ99104 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Myo5aQ99104 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Myo5aQ99104 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC31.01■■■□□ 2.56
Myo5aQ99104 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Myo5aQ99104 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Myo5aQ99104 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Myo5aQ99104 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Myo5aQ99104 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Myo5aQ99104 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Myo5aQ99104 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Myo5aQ99104 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Myo5aQ99104 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Myo5aQ99104 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Myo5aQ99104 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Myo5aQ99104 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Myo5aQ99104 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Myo5aQ99104 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Myo5aQ99104 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms