Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
Rnf217D3YYI7 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
Rnf217D3YYI7 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rnf217D3YYI7 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rnf217D3YYI7 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Rnf217D3YYI7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rnf217D3YYI7 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rnf217D3YYI7 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Rnf217D3YYI7 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Rnf217D3YYI7 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf217D3YYI7 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Rnf217D3YYI7 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Rnf217D3YYI7 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Rnf217D3YYI7 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Rnf217D3YYI7 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Rnf217D3YYI7 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rnf217D3YYI7 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rnf217D3YYI7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf217D3YYI7 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rnf217D3YYI7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rnf217D3YYI7 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rnf217D3YYI7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf217D3YYI7 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Rnf217D3YYI7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rnf217D3YYI7 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Rnf217D3YYI7 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rnf217D3YYI7 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rnf217D3YYI7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rnf217D3YYI7 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rnf217D3YYI7 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Rnf217D3YYI7 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rnf217D3YYI7 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Rnf217D3YYI7 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rnf217D3YYI7 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf217D3YYI7 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rnf217D3YYI7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf217D3YYI7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Rnf217D3YYI7 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rnf217D3YYI7 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Rnf217D3YYI7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Rnf217D3YYI7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf217D3YYI7 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rnf217D3YYI7 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rnf217D3YYI7 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rnf217D3YYI7 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Rnf217D3YYI7 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Rnf217D3YYI7 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Rnf217D3YYI7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Rnf217D3YYI7 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Rnf217D3YYI7 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Rnf217D3YYI7 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Rnf217D3YYI7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rnf217D3YYI7 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rnf217D3YYI7 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Rnf217D3YYI7 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rnf217D3YYI7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Rnf217D3YYI7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rnf217D3YYI7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Rnf217D3YYI7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rnf217D3YYI7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf217D3YYI7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rnf217D3YYI7 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rnf217D3YYI7 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rnf217D3YYI7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rnf217D3YYI7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf217D3YYI7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rnf217D3YYI7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rnf217D3YYI7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rnf217D3YYI7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rnf217D3YYI7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rnf217D3YYI7 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Rnf217D3YYI7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf217D3YYI7 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Rnf217D3YYI7 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Rnf217D3YYI7 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rnf217D3YYI7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rnf217D3YYI7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rnf217D3YYI7 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf217D3YYI7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf217D3YYI7 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Rnf217D3YYI7 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rnf217D3YYI7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rnf217D3YYI7 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rnf217D3YYI7 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rnf217D3YYI7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf217D3YYI7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf217D3YYI7 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf217D3YYI7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf217D3YYI7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf217D3YYI7 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf217D3YYI7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf217D3YYI7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf217D3YYI7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rnf217D3YYI7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf217D3YYI7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf217D3YYI7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf217D3YYI7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf217D3YYI7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf217D3YYI7 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf217D3YYI7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
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