Protein–RNA interactions for Protein: P56542

Dnase2, Deoxyribonuclease-2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnase2P56542 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
Dnase2P56542 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Dnase2P56542 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Dnase2P56542 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dnase2P56542 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Dnase2P56542 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Dnase2P56542 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Dnase2P56542 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Dnase2P56542 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Dnase2P56542 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Dnase2P56542 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Dnase2P56542 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Dnase2P56542 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnase2P56542 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Dnase2P56542 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Dnase2P56542 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Dnase2P56542 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Dnase2P56542 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Dnase2P56542 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Dnase2P56542 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Dnase2P56542 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Dnase2P56542 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dnase2P56542 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dnase2P56542 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dnase2P56542 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dnase2P56542 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Dnase2P56542 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Dnase2P56542 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dnase2P56542 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dnase2P56542 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Dnase2P56542 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dnase2P56542 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dnase2P56542 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dnase2P56542 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Dnase2P56542 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Dnase2P56542 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Dnase2P56542 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Dnase2P56542 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnase2P56542 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dnase2P56542 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Dnase2P56542 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Dnase2P56542 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Dnase2P56542 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dnase2P56542 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Dnase2P56542 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Dnase2P56542 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Dnase2P56542 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Dnase2P56542 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Dnase2P56542 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Dnase2P56542 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnase2P56542 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Dnase2P56542 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Dnase2P56542 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dnase2P56542 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dnase2P56542 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dnase2P56542 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dnase2P56542 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Dnase2P56542 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Dnase2P56542 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dnase2P56542 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dnase2P56542 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dnase2P56542 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dnase2P56542 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnase2P56542 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnase2P56542 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnase2P56542 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dnase2P56542 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Dnase2P56542 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Dnase2P56542 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Dnase2P56542 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Dnase2P56542 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Dnase2P56542 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Dnase2P56542 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Dnase2P56542 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Dnase2P56542 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Dnase2P56542 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnase2P56542 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnase2P56542 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Dnase2P56542 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Dnase2P56542 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Dnase2P56542 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Dnase2P56542 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Dnase2P56542 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnase2P56542 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnase2P56542 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnase2P56542 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Dnase2P56542 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Dnase2P56542 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Dnase2P56542 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Dnase2P56542 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Dnase2P56542 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnase2P56542 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Dnase2P56542 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Dnase2P56542 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnase2P56542 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Dnase2P56542 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Dnase2P56542 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Dnase2P56542 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Dnase2P56542 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Dnase2P56542 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms