Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYM9

Tmeff2, Tomoregulin-2, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff2Q9QYM9 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Tmeff2Q9QYM9 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Tmeff2Q9QYM9 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Tmeff2Q9QYM9 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Tmeff2Q9QYM9 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Tmeff2Q9QYM9 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tmeff2Q9QYM9 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tmeff2Q9QYM9 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tmeff2Q9QYM9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Tmeff2Q9QYM9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Tmeff2Q9QYM9 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmeff2Q9QYM9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Tmeff2Q9QYM9 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmeff2Q9QYM9 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Tmeff2Q9QYM9 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Tmeff2Q9QYM9 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Tmeff2Q9QYM9 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Tmeff2Q9QYM9 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Tmeff2Q9QYM9 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tmeff2Q9QYM9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tmeff2Q9QYM9 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tmeff2Q9QYM9 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Tmeff2Q9QYM9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Tmeff2Q9QYM9 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Tmeff2Q9QYM9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Tmeff2Q9QYM9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Tmeff2Q9QYM9 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Tmeff2Q9QYM9 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tmeff2Q9QYM9 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Tmeff2Q9QYM9 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Tmeff2Q9QYM9 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmeff2Q9QYM9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Tmeff2Q9QYM9 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Tmeff2Q9QYM9 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Tmeff2Q9QYM9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Tmeff2Q9QYM9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Tmeff2Q9QYM9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Tmeff2Q9QYM9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Tmeff2Q9QYM9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Tmeff2Q9QYM9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Tmeff2Q9QYM9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Tmeff2Q9QYM9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Tmeff2Q9QYM9 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Tmeff2Q9QYM9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Tmeff2Q9QYM9 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tmeff2Q9QYM9 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmeff2Q9QYM9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Tmeff2Q9QYM9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Tmeff2Q9QYM9 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tmeff2Q9QYM9 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tmeff2Q9QYM9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tmeff2Q9QYM9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tmeff2Q9QYM9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tmeff2Q9QYM9 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tmeff2Q9QYM9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tmeff2Q9QYM9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tmeff2Q9QYM9 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tmeff2Q9QYM9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tmeff2Q9QYM9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Tmeff2Q9QYM9 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmeff2Q9QYM9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tmeff2Q9QYM9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Tmeff2Q9QYM9 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tmeff2Q9QYM9 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tmeff2Q9QYM9 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tmeff2Q9QYM9 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tmeff2Q9QYM9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tmeff2Q9QYM9 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Tmeff2Q9QYM9 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tmeff2Q9QYM9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tmeff2Q9QYM9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tmeff2Q9QYM9 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tmeff2Q9QYM9 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tmeff2Q9QYM9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmeff2Q9QYM9 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmeff2Q9QYM9 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tmeff2Q9QYM9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tmeff2Q9QYM9 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmeff2Q9QYM9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmeff2Q9QYM9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmeff2Q9QYM9 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmeff2Q9QYM9 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tmeff2Q9QYM9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tmeff2Q9QYM9 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tmeff2Q9QYM9 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tmeff2Q9QYM9 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tmeff2Q9QYM9 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tmeff2Q9QYM9 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tmeff2Q9QYM9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tmeff2Q9QYM9 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tmeff2Q9QYM9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tmeff2Q9QYM9 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tmeff2Q9QYM9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tmeff2Q9QYM9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tmeff2Q9QYM9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmeff2Q9QYM9 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tmeff2Q9QYM9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmeff2Q9QYM9 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmeff2Q9QYM9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.3 ms