Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXA5

Ighv1-15, Immunoglobulin heavy variable 1-15 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ighv1-15A0A0A6YXA5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ighv1-15A0A0A6YXA5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ighv1-15A0A0A6YXA5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ighv1-15A0A0A6YXA5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ighv1-15A0A0A6YXA5 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ighv1-15A0A0A6YXA5 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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