RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523190.5

PVT1-217, Transcript of Pvt1 oncogene, human

TSL 3

Gene PVT1, Length 443 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-217	ENST00000523190	FAM159A	Q6UWV7	190 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	GTSCR1	Q86UQ5	136 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	BORCS7	Q96B45	105 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190		X6R8D5	127 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	AGRN	O00468	2067 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	IGHV1OR15-1	A0A075B7D0	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	KIR2DL5B	A0A0G2JN68	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	KIR2DL5B	A0A0G2JPC4	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	TSTD3	H0UI37	97 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190		H3BS24	57 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	WIPF1	O43516	503 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	SPRY2	O43597	315 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	SNAI2	O43623	268 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	INS	P01308	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	HBB	P68871	147 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	RIG	Q13278	110 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	COX19	Q49B96	90 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	WDR73	Q6P4I2	378 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	RASL11A	Q6T310	242 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	ATP5L2	Q7Z4Y8	100 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	KIR2DL5A	Q8N109	375 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	KCNS1	Q96KK3	526 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	XCL2	Q9UBD3	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	JMJD1C	Q15652	2540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	HLA-DQA1	P01909	254 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	MT-ND6	P03923	174 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	C20orf144	Q9BQM9	153 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	GNB1L	Q9BYB4	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
PVT1-217	ENST00000523190	TRGV11	A0A075B6L2	103 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	IGHV3OR16-12	A0A075B7B8	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	CBY3	A6NI87	242 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190		F2Z2F3	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	PRM2	P04554	102 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	MED14OS	P0DP75	135 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	FABP4	P15090	132 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	HTN1	P15515	57 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	NTF3	P20783	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	NUTF2	P61970	127 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	SLA	Q13239	276 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	TWIST1	Q15672	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	C1orf158	Q8N1D5	194 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	ZNF664	Q8N3J9	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	LINC01587	Q99440	93 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	TMEM208	Q9BTX3	173 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190		A0A1B0GW15	77 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190		G3V4G9	280 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190		M0R381	172 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	APCS	P02743	223 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	CACNG7	P62955	275 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	C9orf85	Q96MD7	179 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	LINC00467	Q9BRT7	94 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	CDIP1	Q9H305	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	GOLT1B	Q9Y3E0	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	SORL1	Q92673	2214 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	LCE2B	O14633	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	AZU1	P20160	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	SRI	P30626	198 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	ZNF415	Q09FC8	603 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	ZNF493	Q6ZR52	646 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	AMN1	Q8IY45	258 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	TMEM256	Q8N2U0	113 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	C1QTNF4	Q9BXJ3	329 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	TMEM191A	Q9H0A3	160 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	CSTL1	Q9H114	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	ZMAT4	Q9H898	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	MAST4	O15021	2626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PVT1-217	ENST00000523190	ATR	Q13535	2644 aa		4.87	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53 ms