RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572010.5

SLC12A4-208, Transcript of solute carrier family 12 member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SLC12A4, Length 1,016 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4-208ENST00000572010 RNF141Q8WVD5 230 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 TRIM63Q969Q1 353 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 UHRF2Q96PU4 802 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 Q9H8V8 135 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 ABCA13Q86UQ4 5058 aa14.85□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 A0A087X0K7 114 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP14.84□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 OR5I1Q13606 314 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 OR10J6PQ8NGY7 276 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 RPUSD4Q96CM3 377 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 ARL6Q9H0F7 186 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 NPVFQ9HCQ7 196 aa14.84□□□□□ -0.03
SLC12A4-208ENST00000572010 ADAP1O75689 374 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC28AQ8IWP9 274 aa14.83□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 H3BMQ9 156 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 H7BYZ3 331 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 SMIM8Q96KF7 97 aa14.82□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 PMS2P5A8MQ11 134 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 SSSCA1O60232 199 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 DLK1P80370 383 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 OR10P1Q8NGE3 313 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 C20orf144Q9BQM9 153 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 ARV1Q9H2C2 271 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 MGAT4CQ9UBM8 478 aa14.81□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 CXCL2P19875 107 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 S100A5P33763 92 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 TTC32Q5I0X7 151 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 PXDC1Q5TGL8 231 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 TEPPQ6URK8 271 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 LCN15Q6UWW0 184 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 PATE2Q6UY27 113 aa14.8□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 C9orf170A2RU37 121 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 GOSR2O14653 212 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 M6PRP20645 277 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 SPATA12Q7Z6I5 190 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC50A1Q9BRV3 221 aa14.79□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 FNDC10F2Z333 226 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 METTL15P1P0C7V9 234 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 LINC00305Q7Z4B0 112 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 RXFP4Q8TDU9 374 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF503Q96F45 646 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 V9GYH0 126 aa14.78□□□□□ -0.04
SLC12A4-208ENST00000572010 A0A0J9YY99 117 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 SNURFLB1AK76 121 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 K7EPK0 472 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 RLN2P04090 185 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 SLC38A11Q08AI6 406 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 CCDC190Q86UF4 302 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa14.77□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 CCNKO75909 580 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 INPP1P49441 399 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF546Q86UE3 836 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 HSPG2P98160 4391 aa14.76□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 GAGE12BA1L429 117 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 GAGE7O76087 117 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 SCGB1D2O95969 90 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 GAGE12FP0CL80 117 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 GAGE12GP0CL81 117 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 GAGE12IP0CL82 117 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 KIR3DS1Q14943 382 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 Q8N1X5 172 aa14.75□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 AGPAT2O15120 278 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 COX7A2P2O60397 106 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 TAS2R30P59541 319 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 GFI1BQ5VTD9 330 aa14.74□□□□□ -0.05
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SLC12A4-208ENST00000572010 Q9H3A6 140 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 SCRT2Q9NQ03 307 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.74□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 A0A1W2PPQ1 181 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 NAP1L6A6NFF2 107 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 H3BNG1 76 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 TSC22D2O75157 780 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 NDUFB6O95139 128 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 OR4E1P0C645 316 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 ESRGQ1W209 222 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 C4orf46Q504U0 113 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 UPK3BQ9BT76 320 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 GGACTQ9BVM4 153 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 GSKIPQ9P0R6 139 aa14.73□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 H3BTX0 84 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 J3KRW8 73 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 HOXA5P20719 270 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 C10orf113Q5VZT2 155 aa14.72□□□□□ -0.05
SLC12A4-208ENST00000572010 FLVCR2Q9UPI3 526 aa14.72□□□□□ -0.05
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