Protein–RNA interactions for Protein: P62487

POLR2G, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB7, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2GP62487 FP236383.1-201ENST00000623860 2498 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.525e-9■■■■■ 157
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POLR2GP62487 SNORD3B-1-202ENST00000617128 218 nt8.72□□□□□ -1.013e-13■■■■■ 60.1
POLR2GP62487 SNORD3B-1-203ENST00000631292 217 nt8.68□□□□□ -1.023e-13■■■■■ 60.1
POLR2GP62487 FP671120.1-201ENST00000623664 2498 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.525e-7■■■■■ 38.2
POLR2GP62487 CYC1-204ENST00000533444 1832 ntTSL 1 (best)22.38■■□□□ 1.174e-10■■■■■ 29.2
POLR2GP62487 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.074e-10■■■■■ 29.2
POLR2GP62487 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.094e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.534e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 NDRG1-203ENST00000517331 584 ntTSL 511.6□□□□□ -0.554e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 NDRG1-222ENST00000522476 1385 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 NDRG1-204ENST00000517599 2918 ntTSL 211□□□□□ -0.654e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 NDRG1-201ENST00000323851 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 NDRG1-229ENST00000537882 2975 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.684e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 NDRG1-212ENST00000519278 3983 ntTSL 29.4□□□□□ -0.94e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 NDRG1-207ENST00000518066 560 ntTSL 5 BASIC9.31□□□□□ -0.924e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 NDRG1-221ENST00000522377 1103 ntTSL 58.5□□□□□ -1.054e-6■■■■■ 28.4
POLR2GP62487 WDR43-202ENST00000407426 3533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.631e-6■■■■□ 25
POLR2GP62487 WDR43-201ENST00000296126 787 ntTSL 51.92□□□□□ -2.11e-6■■■■□ 25
POLR2GP62487 WDR43-204ENST00000440983 541 ntTSL 41.29□□□□□ -2.21e-6■■■■□ 25
POLR2GP62487 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.182e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.222e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.372e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC11.32□□□□□ -0.62e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 FNDC3B-203ENST00000416957 3684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.962e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 FNDC3B-206ENST00000443501 678 ntTSL 36.41□□□□□ -1.382e-6■■■■□ 23.8
POLR2GP62487 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.285e-6■■■■□ 22.7
POLR2GP62487 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.142e-6■■■■□ 22.1
POLR2GP62487 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.262e-6■■■■□ 22.1
POLR2GP62487 MLLT10-202ENST00000377059 4850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.332e-6■■■■□ 22.1
POLR2GP62487 MLLT10-217ENST00000631589 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.482e-6■■■■□ 22.1
POLR2GP62487 MLLT10-208ENST00000438473 1085 ntTSL 54.36□□□□□ -1.712e-6■■■■□ 22.1
POLR2GP62487 MLLT10-206ENST00000420525 538 ntTSL 31.16□□□□□ -2.222e-6■■■■□ 22.1
POLR2GP62487 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.26e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.126e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.176e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.376e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 RREB1-205ENST00000467782 243 ntTSL 511.61□□□□□ -0.556e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 RREB1-206ENST00000471433 1021 ntTSL 59.96□□□□□ -0.826e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 RREB1-209ENST00000491191 998 ntTSL 58.39□□□□□ -1.076e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 RREB1-207ENST00000475946 9067 ntTSL 1 (best)7.47□□□□□ -1.216e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.139e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.019e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.249e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 EHMT1-224ENST00000630754 709 ntTSL 313.19□□□□□ -0.39e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.319e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 EHMT1-201ENST00000371394 2679 ntTSL 212.64□□□□□ -0.399e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.419e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 EHMT1-243ENST00000637593 100 ntTSL 512.43□□□□□ -0.429e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 C2orf48-202ENST00000619640 480 ntTSL 1 (best)11.77□□□□□ -0.539e-6■■■■□ 21.6
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POLR2GP62487 EHMT1-241ENST00000637335 86 ntTSL 57.69□□□□□ -1.189e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 AL590627.2-202ENST00000636318 138 ntTSL 57.57□□□□□ -1.29e-6■■■■□ 21.6
POLR2GP62487 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.084e-6■■■■□ 20.8
POLR2GP62487 ARID3A-205ENST00000587532 1016 ntTSL 513.54□□□□□ -0.244e-6■■■■□ 20.8
POLR2GP62487 NSD2-218ENST00000508355 2092 ntTSL 1 (best)11.74□□□□□ -0.534e-6■■■■□ 20.8
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POLR2GP62487 ARID3A-202ENST00000457152 549 ntTSL 59.22□□□□□ -0.934e-6■■■■□ 20.8
POLR2GP62487 NSD2-219ENST00000508803 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.57□□□□□ -1.24e-6■■■■□ 20.8
POLR2GP62487 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.284e-6■■■■□ 20.8
POLR2GP62487 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.73e-6■■■■□ 20
POLR2GP62487 SUN1-222ENST00000457861 2975 ntTSL 214.22□□□□□ -0.133e-6■■■■□ 20
POLR2GP62487 GET4-203ENST00000412734 873 ntTSL 211.06□□□□□ -0.643e-6■■■■□ 20
POLR2GP62487 CYC1-203ENST00000528618 831 ntTSL 514.01□□□□□ -0.177e-10■■■■□ 19.9
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POLR2GP62487 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.37e-6■■■□□ 17
POLR2GP62487 ZHX2-201ENST00000314393 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.423e-6■■■□□ 17
POLR2GP62487 BNIP3-202ENST00000540159 3066 ntTSL 1 (best)11.79□□□□□ -0.527e-6■■■□□ 17
POLR2GP62487 BNIP3-203ENST00000631806 752 ntTSL 211.6□□□□□ -0.557e-6■■■□□ 17
POLR2GP62487 AGAP1-203ENST00000402604 563 ntTSL 49.06□□□□□ -0.962e-8■■■□□ 17
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POLR2GP62487 PFKFB4-205ENST00000417753 1744 ntTSL 1 (best)18.76■□□□□ 0.598e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.488e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.358e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-238ENST00000521116 806 ntTSL 416.59■□□□□ 0.258e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 PFKFB4-213ENST00000490115 1757 ntTSL 1 (best)15.87■□□□□ 0.138e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-245ENST00000523137 1563 ntTSL 415.24■□□□□ 0.038e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.218e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-228ENST00000515714 690 ntTSL 413.54□□□□□ -0.248e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.298e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.328e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-202ENST00000356731 3667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.368e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.378e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-212ENST00000505087 592 ntTSL 312.45□□□□□ -0.428e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-207ENST00000503105 559 ntTSL 312.45□□□□□ -0.428e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.458e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-208ENST00000503664 569 ntTSL 412.25□□□□□ -0.458e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 SLC2A14-213ENST00000539924 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.528e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-216ENST00000510411 2105 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.548e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-226ENST00000515446 368 ntTSL 211.59□□□□□ -0.558e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-225ENST00000515158 850 ntTSL 411.49□□□□□ -0.578e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-218ENST00000510678 1996 ntTSL 511.29□□□□□ -0.68e-8■■■□□ 15.9
POLR2GP62487 HNRNPH1-213ENST00000505811 1155 ntTSL 511.22□□□□□ -0.618e-8■■■□□ 15.9
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