RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640501.1

PNKP-231, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, humanhuman

TSL 5

Gene PNKP, Length 151 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNKP-231ENST00000640501 GPR183P32249 361 aa6.52□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 C9orf152Q5JTZ5 239 aa6.52□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 C1orf194Q5T5A4 169 aa6.52□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.52□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 METTL26Q96S19 204 aa6.52□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 C12orf57Q99622 126 aa6.52□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.52□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 ZNF580Q9UK33 172 aa6.52□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 V9GYV3 84 aa6.52□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 IZUMO1RA6ND01 250 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 H3BUX3 64 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 LTAP01374 205 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 IGHG2P01859 326 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 AMY1AP04745 511 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 S100A12P80511 92 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 OR5I1Q13606 314 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 LEMD1Q68G75 181 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 PRR27Q6MZM9 219 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 BRD3OSQ6XYD6 125 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 TMEM18Q96B42 140 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 SLC50A1Q9BRV3 221 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 NDFIP1Q9BT67 221 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 GFRA4Q9GZZ7 299 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 ZNF586Q9NXT0 402 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 CFAP46Q8IYW2 2715 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.51□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 A0A1W2PS18 150 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 TMEM89A2RUT3 159 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 A6NDX4 124 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 SLC17A3O00476 420 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 IGLV2-8P01709 118 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 TRGV3P03979 118 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 CLEC3BP05452 202 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 BMI1P35226 326 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 GNG5P63218 68 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 Q6AWC8 147 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 PRSS57Q6UWY2 283 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 Q86TA4 180 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 GBGT1Q8N5D6 347 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 TSKUQ8WUA8 353 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 BORCS7Q96B45 105 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 ZNF414Q96IQ9 312 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 RPP21Q9H633 154 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.5□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 USP24Q9UPU5 2620 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 PLXNB1O43157 2135 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 A0A087X0K7 114 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 TRAV34A0A0B4J273 112 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 A0A1B0GW15 77 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 A1L4Q6 167 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 ZNF785A8K8V0 405 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 SNURFLB1AK76 121 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 F8W735 103 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 TGFAP01135 160 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 COL8A1P27658 744 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 IER3P46695 156 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 TPPP2P59282 170 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 RAB4BP61018 213 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 RPL15P61313 204 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 PSG3Q16557 428 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 DNLZQ5SXM8 178 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 FAM162BQ5T6X4 162 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 SAMD13Q5VXD3 122 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 TOMM20LQ6UXN7 152 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 CLEC19AQ6UXS0 136 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 PRNTQ86SH4 94 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 TMEM219Q86XT9 240 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 NUDT10Q8NFP7 164 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 NUDT11Q96G61 164 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 S4R3C0 116 aa6.49□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 DIRC3C9JPN6 131 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 G3V318 75 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 NDUFA4O00483 81 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 PHOX2AO14813 284 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 IGHV3-23P01764 117 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 RNF224P0DH78 156 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 CRISP2P16562 243 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 ARL3P36405 182 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 SLC35B1P78383 322 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 LY6EQ16553 131 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 FBLN7Q53RD9 439 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 NHLRC2Q8NBF2 726 aa6.48□□□□□ -1.37
PNKP-231ENST00000640501 PIFOQ8TCI5 191 aa6.48□□□□□ -1.37
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