RNA–Protein interactions for RNA: YOR295W

UAF30, Transcript of Subunit of UAF (upstream activation factor) complex, yeast

Gene UAF30, Length 687 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
UAF30	YOR295W	ERR3	P42222	437 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	FHN1	P53279	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	THI22	Q06490	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	ECM3	Q99252	613 aa		4.62	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	HMG2	P12684	1045 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	GFA1	P14742	717 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	SIR1	P21691	654 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	BEM3	P32873	1128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	XRS2	P33301	854 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	TAH11	P47112	604 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	YDL183C	P48569	320 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	SSL2	Q00578	843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	OPY2	Q06810	360 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	CRD1	Q07560	283 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	SSP2	Q08646	371 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	MLH3	Q12083	715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	URA3	P03962	267 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	MTF2	P10849	440 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	PHO11	P35842	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	PSY4	P38193	441 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	PHO12	P38693	467 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	REV7	P38927	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	FTR1	P40088	404 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	STU2	P46675	888 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	IML2	P47031	731 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	FDC1	Q03034	503 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	AAD4	Q07747	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	HOS1	Q12214	470 aa		4.6	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	YCL049C	P25577	312 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	BCS1	P32839	456 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
UAF30	YOR295W	PUG1	P40100	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	YAP1802	P53309	568 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	GTR1	Q00582	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	MRPL13	Q02204	264 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	GIS1	Q03833	894 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	YFT2	Q06676	274 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	RRI2	Q12348	645 aa		4.59	□□□□□ -1.67
UAF30	YOR295W	SSM4	P40318	1319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	PHO5	P00635	467 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	BIK1	P11709	440 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	SEC15	P22224	910 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	ARG1	P22768	420 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	PRP28	P23394	588 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	FEN2	P25621	512 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	RRN3	P36070	627 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	COS111	P38308	924 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	TDP1	P38319	544 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	PPE1	P38796	400 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	ERP2	P39704	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	RAD26	P40352	1085 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	NDC80	P40460	691 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	GSM1	P42950	618 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	COG4	Q06096	861 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	AIM41	Q12032	185 aa		4.58	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	MCM10	P32354	571 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	NPR3	P38742	1146 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	PIG2	P40187	538 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	YIL077C	P40508	320 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	IMA1	P53051	589 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	ACS1	Q01574	713 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	TFC6	Q06339	672 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	ARR3	Q06598	404 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	TAF3	Q12297	353 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	POL3	P15436	1097 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	KIN3	P22209	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	CLB4	P24871	460 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	RER1	P25560	188 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	SET3	P36124	751 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	SMK1	P41808	388 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	BNA1	P47096	177 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	MDR1	P53258	950 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	USV1	Q12132	391 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	CLF1	Q12309	687 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.56	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	NUC1	P08466	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	TUP1	P16649	713 aa		4.55	□□□□□ -1.68
UAF30	YOR295W	YBR138C	P38277	524 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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