RNA–Protein interactions for RNA: YOL006C

TOP1, Transcript of Topoisomerase I, yeast

Gene TOP1, Length 2,310 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TOP1	YOL006C	YSA1	Q01976	231 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YAP6	Q03935	383 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	GTB1	Q04924	702 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	DON1	Q05610	365 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RPN7	Q06103	429 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	GRX6	Q12438	231 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YPR015C	Q12531	247 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YOR111W	Q99210	232 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YLR358C	O13565	187 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YML002W	P0CF17	737 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YLR464W	P0CX17	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YEL043W	P32618	956 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MAC1	P35192	417 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PSD1	P39006	500 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YEL076C	P39971	216 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	EFM4	P40516	257 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	FET5	P43561	622 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	STU2	P46675	888 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	VTC4	P47075	721 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YGR266W	P53326	701 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	HRQ1	Q05549	1077 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SEC39	Q12745	709 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YRF1-4	O13559	1382 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PEP3	P27801	918 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RPC37	P36121	282 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	AHP1	P38013	176 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YER156C	P40093	338 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	FET4	P40988	552 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YJR124C	P47159	448 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YNR040W	P53736	256 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	TOF2	Q02208	771 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	LRS4	Q04087	347 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YLR456W	Q06199	204 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RCN2	Q12044	265 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NBP2	Q12163	236 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	GPM3	Q12326	303 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	DIF1	O13577	133 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	CLB3	P24870	427 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	DGR2	P32330	852 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YKR018C	P36114	725 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	DAD2	P36162	133 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	LYS9	P38999	446 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PTK2	P47116	818 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	TEL2	P53038	688 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NCS6	P53088	359 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	LSB1	P53281	241 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ARP5	P53946	755 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SKG3	Q06315	1026 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YBR182C-A	Q8TGU6	64 aa		3.56	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	RIT1	P23796	513 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YCL002C	P25565	263 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PRO1	P32264	428 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YUH1	P35127	236 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YKL151C	P36059	337 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	TFA2	P36145	328 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YKR075C	P36155	307 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YKR078W	P36158	585 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ARL1	P38116	183 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SRO77	P38163	1010 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	PEX18	P38855	283 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	FLC2	P39719	783 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NEO1	P40527	1151 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MAD2	P40958	196 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SHR5	P41912	237 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	LSB6	P42951	607 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	MET12	P46151	657 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	ARH1	P48360	493 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	BPL1	P48445	690 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	SHE4	P51534	789 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	YNR065C	P53751	1116 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	NGL3	Q03210	505 aa		3.55	□□□□□ -1.84
TOP1	YOL006C	CRR1	Q05790	422 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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