RNA–Protein interactions for RNA: YNL171C

YNL171C, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene YNL171C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL171C	YNL171C	NMA2	P53204	395 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	DIP5	P53388	608 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	PSF3	Q12146	194 aa		4.87	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	ATP4	P05626	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	SPO11	P23179	398 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	KCC4	P25389	1037 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YKL133C	P36066	463 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	BDH2	P39713	417 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YDL183C	P48569	320 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	MNT2	P53059	558 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	SPC98	P53540	846 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	RKI1	Q12189	258 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	HOS1	Q12214	470 aa		4.86	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	TMT1	P32643	299 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	SDS22	P36047	338 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	ASK10	P48361	1146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	MET14	Q02196	202 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	UFO1	Q04511	668 aa		4.85	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	LAM4	P38800	1345 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	SEC12	P11655	471 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	HOP1	P20050	605 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	TGL1	P34163	548 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	TAF5	P38129	798 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	YEL020C	P39994	560 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	MAD2	P40958	196 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	THI6	P41835	540 aa		4.84	□□□□□ -1.63
YNL171C	YNL171C	URA3	P03962	267 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	GAL1	P04385	528 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	ARG1	P22768	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	YJL193W	P39542	402 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	LRO1	P40345	661 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	YNR071C	P53757	342 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	MLC2	Q06580	163 aa		4.83	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	PCK1	P10963	549 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	VPS33	P20795	691 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	CBP3	P21560	335 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	PTP2	P29461	750 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	MRPL7	P36519	292 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	PMT6	P42934	759 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	PIP2	P52960	996 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	SNF12	P53628	566 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	MFM1	Q02783	413 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	ARR3	Q06598	404 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	DIN7	Q12086	430 aa		4.82	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	RIM4	P38741	713 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	GLO1	P50107	326 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	TRS23	Q03784	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	DBP10	Q12389	995 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	HIS6	P40545	261 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	TRI1	Q05024	226 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	ARP7	Q12406	477 aa		4.8	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	ADH4	P10127	382 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	DSS4	P32601	143 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	SWD1	P39706	426 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	TPM2	P40414	161 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	YIP4	P53093	235 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	RTS3	P53289	263 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.79	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	STE4	P18851	423 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	YMC2	P38087	329 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	PIH1	P38768	344 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	GSM1	P42950	618 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	TEP1	P53916	434 aa		4.78	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
YNL171C	YNL171C	BET2	P20133	325 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	CNE1	P27825	502 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	ORC2	P32833	620 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	QRI7	P43122	407 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	BUD17	P53727	317 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	TGS1	Q12052	315 aa		4.77	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	RPN13	O13563	156 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	PHO5	P00635	467 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	STE12	P13574	688 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	MUP3	P38734	546 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	YLF2	P38746	405 aa		4.76	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
YNL171C	YNL171C	MIT1	P40002	666 aa		4.76	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.4 ms