RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeastyeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPT15YER148W MLH3Q12083 715 aa4.7□□□□□ -1.66
SPT15YER148W KAR1P11927 433 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W HCA4P20448 770 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W NTH1P32356 751 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W MSS1P32559 526 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W TFC4P33339 1025 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W CTP1P38152 299 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W NDC80P40460 691 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W SDS3P40505 327 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W PRM2P40534 656 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W MPS3P47069 682 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W RFX1P48743 811 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W PHM6Q05637 104 aa4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
SPT15YER148W ABF1P14164 731 aa4.68□□□□□ -1.66
SPT15YER148W MTC7P32633 139 aa4.68□□□□□ -1.66
SPT15YER148W PEA2P40091 420 aa4.68□□□□□ -1.66
SPT15YER148W PEX8P53248 589 aa4.68□□□□□ -1.66
SPT15YER148W HOL1P53389 586 aa4.68□□□□□ -1.66
SPT15YER148W TMN2Q04562 672 aa4.68□□□□□ -1.66
SPT15YER148W SLX4Q12098 748 aa4.68□□□□□ -1.66
SPT15YER148W CDS1P38221 457 aa4.67□□□□□ -1.66
SPT15YER148W CBR1P38626 284 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SPT15YER148W KHA1P40309 873 aa4.67□□□□□ -1.66
SPT15YER148W PEF1P53238 335 aa4.67□□□□□ -1.66
SPT15YER148W USV1Q12132 391 aa4.67□□□□□ -1.66
SPT15YER148W TAF3Q12297 353 aa4.67□□□□□ -1.66
SPT15YER148W TMA7Q3E764 64 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
SPT15YER148W UBS1P38290 277 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W YHR033WP38690 423 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data4.66□□□□□ -1.66not detected
SPT15YER148W BDH2P39713 417 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W FTR1P40088 404 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W CTR1P49573 406 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W UBA2P52488 636 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W YGR151CP53287 111 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W TGL2P54857 326 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W MTD1Q02046 320 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W YSH1Q06224 779 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W YDL086WQ07505 273 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W IZH3Q07959 543 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W BMS1Q08965 1183 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W VPS5Q92331 675 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W YBT1P32386 1661 aa4.66□□□□□ -1.66
SPT15YER148W TUF1P02992 437 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YEL076C-AP0CX16 216 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YLR464WP0CX17 216 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W HMG2P12684 1045 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W FUB1P25659 250 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W MTH1P35198 433 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W SET3P36124 751 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W GLG1P36143 616 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W SSP120P39931 234 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YEL076CP39971 216 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W GND2P53319 492 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YNL034WP53963 612 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YNL018CP53976 612 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W IOC4Q04213 475 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W ECM38Q05902 660 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W IRC10Q08118 586 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W AIM41Q12032 185 aa4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W CWC2Q12046 339 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
SPT15YER148W GRX7P38068 203 aa4.64□□□□□ -1.67
SPT15YER148W STL1P39932 569 aa4.64□□□□□ -1.67
SPT15YER148W CCT7P42943 550 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SPT15YER148W PUS4P48567 403 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YDL183CP48569 320 aa4.64□□□□□ -1.67
SPT15YER148W CEF1Q03654 590 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YCG1Q06680 1035 aa4.64□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YOR378WQ08902 515 aa4.64□□□□□ -1.67
SPT15YER148W TUP1P16649 713 aa4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W DMC1P25453 334 aa4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W CWH43P25618 953 aa4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YJL206CP39529 758 aa4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W TMN3P40071 706 aa4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W NOP2P40991 618 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W QRI1P43123 477 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W CNM67P53865 581 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W SND1Q04007 877 aa4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
SPT15YER148W CDC43P18898 376 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W RMA1P36001 430 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W GMH1P36125 273 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W APL3P38065 1025 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W YHR097CP38809 366 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W EAF5P39995 279 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W STU2P46675 888 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W MNT2P53059 558 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W SNF12P53628 566 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W SQS1P53866 767 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W PSF3Q12146 194 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data4.62□□□□□ -1.67not detected
SPT15YER148W RKI1Q12189 258 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W BCK1Q01389 1478 aa4.62□□□□□ -1.67
SPT15YER148W VMR1P38735 1592 aa4.61□□□□□ -1.67
SPT15YER148W NUP188P52593 1655 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
SPT15YER148W ATP4P05626 244 aa4.61□□□□□ -1.67
SPT15YER148W HOP1P20050 605 aa4.61□□□□□ -1.67
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