RNA–Protein interactions for RNA: YER148W

SPT15, Transcript of TATA-binding protein, yeast

Gene SPT15, Length 723 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPT15	YER148W	MLH3	Q12083	715 aa		4.7	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	KAR1	P11927	433 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	NTH1	P32356	751 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	TFC4	P33339	1025 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	CTP1	P38152	299 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	NDC80	P40460	691 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	SDS3	P40505	327 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	PRM2	P40534	656 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	MPS3	P47069	682 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	RFX1	P48743	811 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	PHM6	Q05637	104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.69	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	ABF1	P14164	731 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	MTC7	P32633	139 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	PEA2	P40091	420 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	PEX8	P53248	589 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	HOL1	P53389	586 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	TMN2	Q04562	672 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	SLX4	Q12098	748 aa		4.68	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	CDS1	P38221	457 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	KHA1	P40309	873 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	PEF1	P53238	335 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	USV1	Q12132	391 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	TAF3	Q12297	353 aa		4.67	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	UBS1	P38290	277 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	YHR033W	P38690	423 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
SPT15	YER148W	BDH2	P39713	417 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	FTR1	P40088	404 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	CTR1	P49573	406 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	UBA2	P52488	636 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	YGR151C	P53287	111 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	TGL2	P54857	326 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	YDL086W	Q07505	273 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	IZH3	Q07959	543 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	VPS5	Q92331	675 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	YBT1	P32386	1661 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SPT15	YER148W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	HMG2	P12684	1045 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	FUB1	P25659	250 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	MTH1	P35198	433 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	SET3	P36124	751 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	GLG1	P36143	616 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YEL076C	P39971	216 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	GND2	P53319	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YNL034W	P53963	612 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YNL018C	P53976	612 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	IOC4	Q04213	475 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	IRC10	Q08118	586 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	AIM41	Q12032	185 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	GRX7	P38068	203 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	STL1	P39932	569 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YDL183C	P48569	320 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YOR378W	Q08902	515 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	TUP1	P16649	713 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	DMC1	P25453	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	CWH43	P25618	953 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YJL206C	P39529	758 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	TMN3	P40071	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	CNM67	P53865	581 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	SND1	Q04007	877 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	CDC43	P18898	376 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	GMH1	P36125	273 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	APL3	P38065	1025 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	YHR097C	P38809	366 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	EAF5	P39995	279 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	STU2	P46675	888 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	MNT2	P53059	558 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	SNF12	P53628	566 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	PSF3	Q12146	194 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	MSL5	Q12186	476 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
SPT15	YER148W	RKI1	Q12189	258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	VMR1	P38735	1592 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	ATP4	P05626	244 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SPT15	YER148W	HOP1	P20050	605 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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