RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446903.5

TNS1-210, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TNS1, Length 2,464 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-210ENST00000446903 RAI14Q9P0K7 980 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 CCDC183Q5T5S1 534 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 TXNRD3Q86VQ6 643 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.23■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 GOLGA8BA8MQT2 603 aa16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 KRT85P78386 507 aa16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 ELP1O95163 1332 aa16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 NPHP1O15259 732 aa16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 CHMP4CQ96CF2 233 aa16.22■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 CRY2Q49AN0 593 aa16.21■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 AKNAD1Q5T1N1 836 aa16.21■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 SENP2Q9HC62 589 aa16.21■□□□□ 0.19
TNS1-210ENST00000446903 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa16.21■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 H3BQV1 296 aa16.21■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 IFFO2Q5TF58 517 aa16.21■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 STAG1Q8WVM7 1258 aa16.21■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 TMEM87BQ96K49 555 aa16.21■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.21■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 CCDC39Q9UFE4 941 aa16.21■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 PPFIA3O75145 1194 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 OFD1O75665 1012 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 TDO2P48775 406 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 TXNRD1Q16881 649 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 SERPINB2P05120 415 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 DDR1Q08345 913 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 LY9Q9HBG7 655 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ZSWIM5Q9P217 1185 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 KIF3AQ9Y496 699 aa16.2■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ADD1P35611 737 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 UVSSAQ2YD98 709 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 KLHL34Q8N239 644 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 FOSBP53539 338 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 APOA5Q6Q788 366 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 SGMS1Q86VZ5 419 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 CNNM2Q9H8M5 875 aa16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP16.19■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 KDM4AO75164 1064 aa16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 MECOMQ03112 1051 aa16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ANAPC4Q9UJX5 808 aa16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 PPARAQ07869 468 aa16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 KRT23Q9C075 422 aa16.18■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 LIFRP42702 1097 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ECM29Q5VYK3 1845 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 XDHP47989 1333 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 SMIM22K7EJ46 135 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 TPM2P07951 284 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 PRDX5P30044 214 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ST5P78524 1137 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 TMEM67Q5HYA8 995 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 BRIP1Q9BX63 1249 aa16.17■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 TPRNQ4KMQ1 711 aa16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 SPATA32Q96LK8 384 aa16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 DUOX1Q9NRD9 1551 aa16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 NID2Q14112 1375 aa16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 CDC27P30260 824 aa16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 GUCY1B3Q02153 619 aa16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 ZNF827Q17R98 1081 aa16.16■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 RXRAP19793 462 aa16.15■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 GPSM2P81274 684 aa16.15■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
TNS1-210ENST00000446903 LRRC37AA6NMS7 1700 aa16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms