RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000218686.1

Trappc6b-207, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

TSL 3 BASIC

Gene Trappc6b, Length 785 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Txnrd3Q99MD6 652 aa26.58■■□□□ 1.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 LratQ9JI60 231 aa26.58■■□□□ 1.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sart3Q9JLI8 962 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mapkapk5O54992 473 aa26.57■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Irf5P56477 497 aa26.57■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem87bQ8BKU8 555 aa26.57■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prkag2Q91WG5 566 aa26.57■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rfc4Q99J62 364 aa26.57■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Leng1Q9DB98 261 aa26.57■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cfap99A0A140LIX9 648 aa26.56■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Erc2Q6PH08 957 aa26.56■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SynrgQ5SV85 1306 aa26.56■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Szt2A2A9C3 3431 aa26.55■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Prl3d3A0A0M6L0J6 224 aa26.55■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cwc27Q3TKY6 469 aa26.55■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Olfm4Q3UZZ4 505 aa26.55■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rbm27Q5SFM8 1060 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Hoxd10P28359 340 aa26.54■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tbc1d9Q3UYK3 1264 aa26.54■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Spint1Q9R097 507 aa26.54■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Duxf3A0A0N4SV92 674 aa26.53■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Speer4dL7N216 212 aa26.53■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gja8P28236 440 aa26.53■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Dhx38Q80X98 1228 aa26.53■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp1r42Q8R1Z4 357 aa26.53■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NsmfQ99NF2 532 aa26.53■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm3893E9Q1I1 302 aa26.52■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp2c37P56654 490 aa26.52■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc7a3P70423 618 aa26.52■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 XdhQ00519 1335 aa26.52■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa26.52■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cyp2c50Q91X77 490 aa26.52■■□□□ 1.84
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pitpnm2Q6ZPQ6 1335 aa26.51■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 NeflP08551 543 aa26.51■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Lins1Q3U1D0 764 aa26.51■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Slc4a10Q5DTL9 1118 aa26.51■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ankrd13aQ80UP5 588 aa26.51■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Srgap3Q812A2 1099 aa26.51■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Q8C5K5 320 aa26.51■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Piezo1E2JF22 2547 aa26.51■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa26.51■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PrkczQ02956 592 aa26.5■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mboat7Q8CHK3 473 aa26.5■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 OgdhlE9Q7L0 1029 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pagr1bF6V0H0 108 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AppP12023 770 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Trap1aP19473 224 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Bace1P56818 501 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tigd5Q499M4 642 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Aoc2Q812C9 757 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Uba5Q8VE47 403 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 HnrnpuQ8VEK3 800 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pagr1aQ99L02 253 aa26.49■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa26.48■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 A0A1W2P7S8 802 aa26.48■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 YdjcQ14BV6 310 aa26.48■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tnnt3Q9QZ47 272 aa26.48■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Flvcr1B2RXV4 560 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Eya2O08575 532 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Sult6b1P0CC03 303 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 SqleP52019 572 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fam13aQ8BGI4 693 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Map10Q8BJS7 891 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ptcd2Q8R3K3 381 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ciao1Q99KN2 339 aa26.47■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atrnl1Q6A051 1378 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Pa2g4P50580 394 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rbm15bQ6PHZ5 887 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tmem179Q8BHH9 233 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fbxo3Q9DC63 480 aa26.46■■□□□ 1.83
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atp8a2P98200 1148 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Smoc2Q8CD91 447 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 DcpsQ9DAR7 338 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 CsadQ9DBE0 493 aa26.45■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Gm4340L7N2C4 268 aa26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Csf2raQ00941 388 aa26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Itm2cQ91VK4 269 aa26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Elp3Q9CZX0 547 aa26.44■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Mmp8O70138 465 aa26.43■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Btg4O70552 250 aa26.43■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Fdx1P46656 188 aa26.43■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Arl14Q3SXC5 192 aa26.43■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kif22Q3V300 660 aa26.43■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atg9aQ68FE2 551 aa26.43■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Rrs1Q9CYH6 365 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nck2O55033 380 aa26.42■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa26.42■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa26.42■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Ppp4r3aQ6P2K6 820 aa26.42■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Snx17Q8BVL3 470 aa26.42■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa26.42■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Nphp1Q9QY53 687 aa26.42■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Kdm3aQ6PCM1 1323 aa26.41■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 PomkQ3TUA9 349 aa26.41■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 AsnsQ61024 561 aa26.41■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Cracr2bQ80ZJ8 394 aa26.41■■□□□ 1.82
Trappc6b-207ENSMUST00000218686 Atxn7Q8R4I1 867 aa26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 19.4 ms