Protein–RNA interactions for Protein: Q00519

Xdh, Xanthine dehydrogenase/oxidase, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XdhQ00519 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
XdhQ00519 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
XdhQ00519 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
XdhQ00519 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
XdhQ00519 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
XdhQ00519 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.02■■■■□ 3.84
XdhQ00519 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
XdhQ00519 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.7■■■■□ 3.79
XdhQ00519 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.46■■■■□ 3.75
XdhQ00519 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
XdhQ00519 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
XdhQ00519 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
XdhQ00519 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
XdhQ00519 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
XdhQ00519 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.21■■■■□ 3.55
XdhQ00519 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
XdhQ00519 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
XdhQ00519 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
XdhQ00519 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.81■■■■□ 3.48
XdhQ00519 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
XdhQ00519 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
XdhQ00519 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
XdhQ00519 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
XdhQ00519 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
XdhQ00519 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
XdhQ00519 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
XdhQ00519 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
XdhQ00519 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
XdhQ00519 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
XdhQ00519 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
XdhQ00519 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
XdhQ00519 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
XdhQ00519 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.74■■■■□ 3.31
XdhQ00519 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
XdhQ00519 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
XdhQ00519 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
XdhQ00519 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
XdhQ00519 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.24■■■■□ 3.23
XdhQ00519 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
XdhQ00519 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
XdhQ00519 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
XdhQ00519 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
XdhQ00519 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
XdhQ00519 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
XdhQ00519 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
XdhQ00519 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
XdhQ00519 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
XdhQ00519 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
XdhQ00519 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
XdhQ00519 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
XdhQ00519 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
XdhQ00519 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.34■■■■□ 3.09
XdhQ00519 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.09
XdhQ00519 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
XdhQ00519 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
XdhQ00519 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
XdhQ00519 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.06
XdhQ00519 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
XdhQ00519 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
XdhQ00519 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
XdhQ00519 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
XdhQ00519 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
XdhQ00519 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
XdhQ00519 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
XdhQ00519 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
XdhQ00519 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
XdhQ00519 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
XdhQ00519 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
XdhQ00519 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
XdhQ00519 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
XdhQ00519 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
XdhQ00519 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.82■■■■□ 3.01
XdhQ00519 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
XdhQ00519 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
XdhQ00519 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
XdhQ00519 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
XdhQ00519 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.68■■■□□ 2.98
XdhQ00519 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
XdhQ00519 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
XdhQ00519 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
XdhQ00519 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
XdhQ00519 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
XdhQ00519 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
XdhQ00519 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
XdhQ00519 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
XdhQ00519 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
XdhQ00519 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
XdhQ00519 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
XdhQ00519 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
XdhQ00519 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
XdhQ00519 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
XdhQ00519 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
XdhQ00519 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
XdhQ00519 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
XdhQ00519 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
XdhQ00519 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
XdhQ00519 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
XdhQ00519 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
XdhQ00519 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
XdhQ00519 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 957.5 ms