Protein–RNA interactions for Protein: Q6A051

Atrnl1, Attractin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atrnl1Q6A051 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC45.86■■■■■ 4.93
Atrnl1Q6A051 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Atrnl1Q6A051 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
Atrnl1Q6A051 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC39.92■■■■□ 3.98
Atrnl1Q6A051 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
Atrnl1Q6A051 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC39.09■■■■□ 3.85
Atrnl1Q6A051 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
Atrnl1Q6A051 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.65■■■■□ 3.78
Atrnl1Q6A051 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Atrnl1Q6A051 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
Atrnl1Q6A051 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
Atrnl1Q6A051 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
Atrnl1Q6A051 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Atrnl1Q6A051 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Atrnl1Q6A051 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
Atrnl1Q6A051 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
Atrnl1Q6A051 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC36.94■■■■□ 3.5
Atrnl1Q6A051 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC36.81■■■■□ 3.48
Atrnl1Q6A051 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
Atrnl1Q6A051 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Atrnl1Q6A051 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Atrnl1Q6A051 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
Atrnl1Q6A051 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
Atrnl1Q6A051 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Atrnl1Q6A051 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Atrnl1Q6A051 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Atrnl1Q6A051 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Atrnl1Q6A051 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Atrnl1Q6A051 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Atrnl1Q6A051 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Atrnl1Q6A051 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Atrnl1Q6A051 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Atrnl1Q6A051 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC35.88■■■■□ 3.34
Atrnl1Q6A051 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Atrnl1Q6A051 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Atrnl1Q6A051 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Atrnl1Q6A051 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Atrnl1Q6A051 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Atrnl1Q6A051 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC35.23■■■■□ 3.23
Atrnl1Q6A051 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Atrnl1Q6A051 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Atrnl1Q6A051 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
Atrnl1Q6A051 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Atrnl1Q6A051 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Atrnl1Q6A051 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
Atrnl1Q6A051 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Atrnl1Q6A051 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Atrnl1Q6A051 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Atrnl1Q6A051 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Atrnl1Q6A051 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Atrnl1Q6A051 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
Atrnl1Q6A051 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Atrnl1Q6A051 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Atrnl1Q6A051 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Atrnl1Q6A051 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Atrnl1Q6A051 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Atrnl1Q6A051 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Atrnl1Q6A051 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
Atrnl1Q6A051 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Atrnl1Q6A051 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Atrnl1Q6A051 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Atrnl1Q6A051 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Atrnl1Q6A051 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Atrnl1Q6A051 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Atrnl1Q6A051 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atrnl1Q6A051 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Atrnl1Q6A051 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Atrnl1Q6A051 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Atrnl1Q6A051 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Atrnl1Q6A051 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Atrnl1Q6A051 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Atrnl1Q6A051 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Atrnl1Q6A051 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Atrnl1Q6A051 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Atrnl1Q6A051 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC33.76■■■■□ 3
Atrnl1Q6A051 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Atrnl1Q6A051 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Atrnl1Q6A051 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Atrnl1Q6A051 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
Atrnl1Q6A051 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Atrnl1Q6A051 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
Atrnl1Q6A051 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Atrnl1Q6A051 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atrnl1Q6A051 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
Atrnl1Q6A051 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Atrnl1Q6A051 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Atrnl1Q6A051 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Atrnl1Q6A051 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Atrnl1Q6A051 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
Atrnl1Q6A051 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Atrnl1Q6A051 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Atrnl1Q6A051 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Atrnl1Q6A051 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Atrnl1Q6A051 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Atrnl1Q6A051 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Atrnl1Q6A051 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Atrnl1Q6A051 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Atrnl1Q6A051 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
Atrnl1Q6A051 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
Atrnl1Q6A051 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms