RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	HOXB5	P09067	269 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	IGLC1	P0CG04	106 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	BMI1	P35226	326 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	GPX4	P36969	197 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	RND2	P52198	227 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	COQ8A	Q8NI60	647 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	RNF2	Q99496	336 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	SRD5A3	Q9H8P0	318 aa		10.43	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	ANXA7	P20073	488 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	NPPC	P23582	126 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	ID3	Q02535	119 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	TIGIT	Q495A1	244 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	NPIPB3	Q92617	1050 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	SPATA25	Q9BR10	227 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	WFDC10A	Q9H1F0	79 aa		10.42	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821		A0A1W2PS18	150 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	OR4C46	A6NHA9	309 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	SYNGR2	O43760	224 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	TCRB	P04435	133 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	IFNA4	P05014	189 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	CRYBB3	P26998	211 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	OR10J1	P30954	320 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	CMC4	P56277	68 aa	Predicted RBP	10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	C4orf46	Q504U0	113 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821		Q8WTZ3	238 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	ST8SIA2	Q92186	375 aa		10.41	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	ADAP1	O75689	374 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	IFNA21	P01568	189 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	APOH	P02749	345 aa	Predicted RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	RAB11A	P62491	216 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	RPP30	P78346	268 aa	Known RBP	10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	LILRB2	Q8N423	598 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	MITD1	Q8WV92	249 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	METTL26	Q96S19	204 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	C20orf85	Q9H1P6	137 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM231	Q9H6L2	316 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821		U3KQE9	123 aa		10.4	□□□□□ -0.74
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3OR16-13	A0A075B7E8	117 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3-74	A0A0B4J1X5	117 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	TOMM40	O96008	361 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	IAPP	P10997	89 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	GAMT	Q14353	236 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	ODF3L2	Q3SX64	289 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	TCF24	Q7RTU0	167 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	OR4D5	Q8NGN0	318 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	CITED4	Q96RK1	184 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	BATF3	Q9NR55	127 aa		10.39	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	MPTX1	A8MV57	137 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	DFFB	O76075	338 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	RD3L	P0DJH9	198 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	NKX2-1	P43699	371 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	PAFAH1B2	P68402	229 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	ACY3	Q96HD9	319 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	GGTLC1	Q9BX51	225 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	MAGT1	Q9H0U3	335 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		10.38	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	PRSS46	E5RG02	174 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	WRB	O00258	174 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	ASAH1	Q13510	395 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	NARS2	Q96I59	477 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	SLC35E1	Q96K37	410 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	10.37	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	UBQLN2	Q9UHD9	624 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	TBC1D24	Q9ULP9	559 aa		10.37	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	IGKV1D-37	A0A075B6S9	117 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	IGHV3-66	A0A0C4DH42	116 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	HNRNPC	P07910	306 aa	Known RBP eCLIP	10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	PSG1	P11464	419 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	POLR2G	P62487	172 aa	Known RBP eCLIP	10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF846	Q147U1	533 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF431	Q8TF32	576 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	GRAMD2B	Q96HH9	432 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	SMIM8	Q96KF7	97 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	TRGV9	Q99603	122 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	MS4A6A	Q9H2W1	248 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	NUDT15	Q9NV35	164 aa		10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	STRAP	Q9Y3F4	350 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	ZFP92	A6NM28	416 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	C3orf84	H3BNL1	204 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	DNASE2	O00115	360 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	UPK1B	O75841	260 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	IL4	P05112	153 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	FABP1	P07148	127 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	H2AFB2	P0C5Z0	115 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	P2RY1	P47900	373 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	SPANXN5	Q5MJ07	72 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	GBGT1	Q8N5D6	347 aa		10.35	□□□□□ -0.75
GGA3-215	ENST00000582821	THAP8	Q8NA92	274 aa		10.35	□□□□□ -0.75

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