RNA–Protein interactions for RNA: tS(GCU)Q1

tS(GCU)Q1, Transcript of Mitochondrial serine tRNA (tRNA-Ser), yeastyeast

Gene tS(GCU)Q1, Length 86 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP0.64□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CYB2P00175 591 aa0.63□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ACO1P19414 778 aaKnown RBP RIP-Chip data0.63□□□□□ -2.31not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HBS1P32769 611 aaKnown RBP0.63□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MNR2P35724 969 aa0.63□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PBY1P38254 753 aa0.63□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSF1P38789 453 aaPredicted RBP0.63□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIL077CP40508 320 aa0.63□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJR107WP47145 328 aa0.63□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TLG2Q08144 397 aa0.63□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BI2P03873 423 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFL068WP0CX99 160 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLL066W-AP0CY00 160 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YLL067W-AP0CY01 160 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 EMC3P36039 253 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR284WP38150 797 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MTC6P38849 526 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IPL1P38991 367 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YND1P40009 630 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFL015CP43578 164 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SAE2P46946 345 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FAA4P47912 694 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BET4Q00618 327 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SND1Q04007 877 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GFD1Q04839 188 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FAB1P34756 2278 aa0.62□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CBS2P14905 389 aa0.61□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AKL1P38080 1108 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MIP6P38760 659 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TOM71P38825 639 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 IGO1P53897 168 aa0.61□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GDE1Q02979 1223 aa0.61□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 DIG1Q03063 452 aaKnown RBP0.61□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR514CQ04408 483 aa0.61□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MRP8P35719 219 aa0.6□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PET10P36139 283 aa0.6□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 AVT5P38176 459 aa0.6□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 COS111P38308 924 aa0.6□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TY4A-JP47023 414 aa0.6□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 VTC3Q02725 835 aa0.6□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFT2Q06676 274 aa0.6□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YER175W-AQ8TGU4 54 aa0.6□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRP9P19736 530 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SEC15P22224 910 aa0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BZZ1P38822 633 aa0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MNN1P39106 762 aa0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNL195CP40168 261 aa0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TDA10P42938 290 aa0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 POL32P47110 350 aa0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YIP4P53093 235 aa0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 FMP42Q04991 504 aa0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GPN2Q08726 347 aaPredicted RBP0.59□□□□□ -2.31
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YML002WP0CF17 737 aa0.58□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CNE1P27825 502 aa0.58□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 KRE9P39005 276 aa0.58□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MSD1P15179 658 aaKnown RBP0.57□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YGR283CP53336 341 aaPredicted RBP0.57□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 POM34Q12445 299 aa0.57□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CDC23P16522 626 aa0.56□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HXT1P32465 570 aa0.56□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SRO77P38163 1010 aa0.56□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YHR218WP38899 603 aa0.56□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GYP8P43570 497 aa0.56□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPO1P53541 631 aa0.56□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPL216WQ08964 1102 aa0.56□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GAL4P04386 881 aa0.55□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YFL052WP43551 465 aa0.55□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MFM1Q02783 413 aa0.55□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 WAR1Q03631 944 aa0.55□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 HRD3Q05787 833 aa0.55□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RPN7Q06103 429 aaKnown RBP0.55□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YBR298C-AQ8TGK4 73 aa0.55□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 CET1O13297 549 aaPredicted RBP0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ATE1P16639 503 aa0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 RNR3P21672 869 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PRO3P32263 286 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SPG5P42933 373 aa0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ALY2P47029 1046 aa0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BNA2P47125 453 aa0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SNU56Q03782 492 aaKnown RBP0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GSH2Q08220 491 aa0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TAH18Q12181 623 aa0.54□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PPE1P38796 400 aa0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 PTH1P38876 190 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YJL070CP40361 888 aa0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YPT11P48559 417 aa0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BUD17P53727 317 aa0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YNL058CP53947 316 aa0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OYE2Q03558 400 aaKnown RBP0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 YDR338CQ05497 695 aa0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 OPI10Q08202 246 aa0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 MET7Q08645 548 aa0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 TGS1Q12052 315 aa0.53□□□□□ -2.32
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ILS1P09436 1072 aaKnown RBP0.52□□□□□ -2.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data0.52□□□□□ -2.33not detected
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 GSH1P32477 678 aa0.52□□□□□ -2.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 SLD2P34252 453 aa0.52□□□□□ -2.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 BRN1P38170 754 aa0.52□□□□□ -2.33
tS(GCU)Q1tS(GCU)Q1 ALR2P43553 858 aa0.52□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 40.7 ms