RNA–Protein interactions for RNA: YKR104W

YKR104W, Transcript of Putative transporter of the MRP subfamily, yeast

Gene YKR104W, Length 921 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR104W	YKR104W	YML122C	Q03207	126 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	YLR001C	Q07895	862 aa		5.89	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	RAD18	P10862	487 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	MIH1	P23748	554 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	LYS9	P38999	446 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	GID8	P40208	455 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	ARG2	P40360	574 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	NDC80	P40460	691 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	HMO1	Q03973	246 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	NTE1	Q04958	1679 aa		5.88	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	PTP2	P29461	750 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	NIC96	P34077	839 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	SFB3	P38810	929 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	YJL206C	P39529	758 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	YIL166C	P40445	542 aa		5.87	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	MTQ2	Q03920	221 aa	Predicted RBP	5.87	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	GAL1	P04385	528 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	MGS1	P40151	587 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	TAH11	P47112	604 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	CTR1	P49573	406 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	DIA2	Q08496	732 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	TAF3	Q12297	353 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	RRI2	Q12348	645 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	HIF1	Q12373	385 aa		5.86	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	PCL2	P25693	308 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	YKL133C	P36066	463 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	GLG1	P36143	616 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	APN2	P38207	520 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	EXO84	P38261	753 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	ATG4	P53867	494 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	ATG33	Q06485	197 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	PSR2	Q07949	397 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	DNF2	Q12675	1612 aa		5.85	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	AEP2	P22136	580 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	PEX1	P24004	1043 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	NFU1	P32860	256 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	FHN1	P53279	174 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	MLC2	Q06580	163 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	NDJ1	Q12366	352 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	ZRT2	Q12436	422 aa		5.84	□□□□□ -1.47
YKR104W	YKR104W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	PPZ2	P33329	710 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	TFC3	P34111	1160 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	PHO11	P35842	467 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	PCM1	P38628	557 aa	Known RBP	5.83	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	PHO12	P38693	467 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	BDH2	P39713	417 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	SUT2	Q12286	268 aa		5.83	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	TOP2	P06786	1428 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	HMG1	P12683	1054 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	SFL1	P20134	766 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	MAL31	P38156	614 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.82	□□□□□ -1.48	not detected
YKR104W	YKR104W	GET2	P40056	285 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	SAP185	P40856	1058 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	MET13	P53128	600 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	COX18	P53239	316 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	ARP4	P80428	489 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	YML131W	Q03102	365 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	MMS22	Q06164	1454 aa		5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	RPO21	P04050	1733 aa	Known RBP	5.82	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	RPN13	O13563	156 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	CCT7	P42943	550 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	YJR096W	P47137	282 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	AIM14	P53109	570 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	PHM6	Q05637	104 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	RTP1	Q12751	981 aa		5.81	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	FOB1	O13329	566 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	KCC4	P25389	1037 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	PIG2	P40187	538 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	YJR039W	P47107	1121 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	SRB7	P47822	140 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	RMP1	Q12530	201 aa		5.8	□□□□□ -1.48
YKR104W	YKR104W	MMS1	Q06211	1407 aa		5.8	□□□□□ -1.48

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 45.1 ms