RNA–Protein interactions for RNA: YKR057W

RPS21A, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeastyeast

Gene RPS21A, Length 264 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPS21AYKR057W IES3Q12345 250 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS21AYKR057W ARP6Q12509 438 aa3.41□□□□□ -1.86
RPS21AYKR057W YPR089WO13585 888 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TEF1P02994 458 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W PET122P10355 254 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W CDC42P19073 191 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W DBP5P20449 482 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RNR1P21524 888 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SAN1P22470 610 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W DAL2P25335 343 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W GFD2P25370 566 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W BUD23P25627 275 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W CDC20P26309 610 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W HEM3P28789 327 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TFC1P32367 649 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W MET4P32389 672 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RPN2P32565 945 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SUV3P32580 737 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W ABD1P32783 436 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W YSC83P32792 385 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W PGM1P33401 570 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TIF3P34167 436 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W CSG2P35206 410 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TGL4P36165 910 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RIM2P38127 377 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W FES1P38260 290 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W NPT1P39683 429 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W FTR1P40088 404 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W ARG2P40360 574 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W AIM21P40563 679 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RLP7P40693 322 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W MKT1P40850 830 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W MAD3P47074 515 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RFX1P48743 811 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W YML6P51998 286 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W MRM2P53123 320 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W YGL108CP53139 140 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W LSB1P53281 241 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W ASI2P53895 289 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SFB2P53953 876 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TMA20P89886 181 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RNY1Q02933 434 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W MSH6Q03834 1242 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SPO71Q03868 1245 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SAS4Q04003 481 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RAD30Q04049 632 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W PRM6Q04705 352 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W DUS4Q06063 367 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W BCP1Q06338 283 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W UTP4Q06679 776 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W YET3Q07451 203 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W NOC3Q07896 663 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W NFI1Q12216 726 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W AVL9Q12500 764 aa3.4□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SEM1O94742 89 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W PHR1P05066 565 aaKnown RBP RIP-Chip data3.39□□□□□ -1.87not detected
RPS21AYKR057W HSF1P10961 833 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W KIN1P13185 1064 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W PDC5P16467 563 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RGR1P19263 1082 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W PRP6P19735 899 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RET1P22276 1149 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W CLB2P24869 491 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SNT1P25357 1226 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W PHO87P25360 923 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W ADP1P25371 1049 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W URA7P28274 579 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W BDF1P35817 686 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RCN1P36054 211 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W KAP104P38217 918 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TOS1P38288 455 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W ERC1P38767 581 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W BRL1P38770 471 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W DYS1P38791 387 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W FRT2P39734 528 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SSP120P39931 234 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TMN3P40071 706 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TGL3P40308 642 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RIC1P40395 1056 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TMA108P40462 946 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W FIS1P40515 155 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SYG1P40528 902 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SNL1P40548 159 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W INP51P40559 946 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W RGD2P43556 714 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W FMP32P43557 207 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W LAM5P43560 674 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W ALY2P47029 1046 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W CPR7P47103 393 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W VMA10P48836 114 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W IMD4P50094 524 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W NUP84P52891 726 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W TAM41P53230 385 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W COG2P53271 262 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W PRO2P54885 456 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W ULP1Q02724 621 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W FMP30Q02883 468 aa3.39□□□□□ -1.87
RPS21AYKR057W SRL4Q03085 281 aa3.39□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 205.6 ms