RNA–Protein interactions for RNA: YKR047W

YKR047W, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKR047W, Length 306 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR047WYKR047W PUG1P40100 303 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W PRM2P40534 656 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W FAF1P40546 346 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MDR1P53258 950 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W TRI1Q05024 226 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W EIS1Q05050 843 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W YLR224WQ05947 369 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W YDR056CQ12025 205 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W POM34Q12445 299 aa5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W HRP1Q99383 534 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MIS1P09440 975 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W HSC82P15108 705 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W NCP1P16603 691 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W SIR1P21691 654 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W CLB4P24871 460 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W KAR4P25583 335 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W SLC1P33333 303 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W CTF13P35203 478 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W PSF2P40359 213 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W TMA108P40462 946 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W CCT8P47079 568 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W TAH11P47112 604 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W SPT20P50875 604 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MRPS35P53292 345 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MDM1Q01846 1127 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W DFG16Q99234 619 aa5.32□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W ARG1P22768 420 aa5.31□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W SEG2P34250 1132 aa5.31□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W GET2P40056 285 aa5.31□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W FKH2P41813 862 aa5.31□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W YDR132CQ03900 495 aa5.31□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W INH1P01097 85 aa5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MTF2P10849 440 aa5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W UBC1P21734 215 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W RPT3P33298 428 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MFT1P33441 392 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W AIM21P40563 679 aa5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W ACS1Q01574 713 aa5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W YCG1Q06680 1035 aa5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W AAD4Q07747 329 aa5.3□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W PCK1P10963 549 aa5.29□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W PEX1P24004 1043 aa5.29□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W SWI4P25302 1093 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W CDS1P38221 457 aa5.29□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W YBR138CP38277 524 aa5.29□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W BNA1P47096 177 aa5.29□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MTL1P53214 551 aa5.29□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W CRD1Q07560 283 aa5.29□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W AIM41Q12032 185 aa5.29□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W TUP1P16649 713 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W RIT1P23796 513 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W JNM1P36224 373 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W MRPL36P36531 177 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W SFB3P38810 929 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W CRG1P38892 291 aaRIP-Chip data5.28□□□□□ -1.56not detected
YKR047WYKR047W LYS9P38999 446 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W UME6P39001 836 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W FTR1P40088 404 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W SAP4P53036 818 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W ESF2P53743 316 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W ARA2Q04212 335 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W VID22Q05934 901 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W THI22Q06490 572 aa5.28□□□□□ -1.56
YKR047WYKR047W RPS13P05756 151 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W SNF1P06782 633 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W ADE3P07245 946 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W IFA38P38286 347 aa5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W AXL2P38928 823 aa5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W NDE1P40215 560 aa5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W YIL077CP40508 320 aa5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W GSM1P42950 618 aa5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W LSB3P43603 459 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W YDL183CP48569 320 aa5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W RTP1Q12751 981 aa5.27□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W TUF1P02992 437 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W LAT1P12695 482 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W GUK1P15454 187 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W RAD16P31244 790 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W IMP2'P32351 346 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W FRD1P32614 470 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W OMA1P36163 345 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W COS111P38308 924 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W NPR3P38742 1146 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W CAB2P40506 365 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W YIR042CP40586 236 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W ECL1P48235 211 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W CTF18P49956 741 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W ERG5P54781 538 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W GIR2Q03768 265 aaPredicted RBP5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W CSR1Q06705 408 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W MED1Q12321 566 aa5.26□□□□□ -1.57
YKR047WYKR047W ENT1Q12518 454 aa5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 24.5 ms