RNA–Protein interactions for RNA: YKL137W

CMC1, Transcript of Copper-binding protein of the mitochondrial intermembrane space, yeast

Gene CMC1, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CMC1	YKL137W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	HLR1	Q04429	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	AIM41	Q12032	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	EMP70	P32802	667 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	YHR033W	P38690	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	YEN1	P40028	759 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	MRK1	P50873	501 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	SKY1	Q03656	742 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	ARO10	Q06408	635 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	TRE2	Q08693	809 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	LAM4	P38800	1345 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	AEP2	P22136	580 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	GRX4	P32642	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	YPT53	P36019	220 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	TMN3	P40071	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	PMT6	P42934	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	CDC26	P14724	124 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	ELF1	P36053	145 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	YMC2	P38087	329 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	PAC2	P39937	518 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	PRM2	P40534	656 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
CMC1	YKL137W	EUG1	P32474	517 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	PPE1	P38796	400 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
CMC1	YKL137W	FTR1	P40088	404 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	ATG36	P46983	293 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	BNR1	P40450	1375 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	STE12	P13574	688 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	TSR4	P25040	408 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	PIH1	P38768	344 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	EMP65	P40085	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	SPC105	P53148	917 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	IMO32	P53219	342 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	SNF12	P53628	566 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	YML122C	Q03207	126 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CMC1	YKL137W	TPK2	P06245	380 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	PEA2	P40091	420 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	NIT2	P47016	307 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	SLD3	P53135	668 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	COQ11	Q05892	277 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	PHO5	P00635	467 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	TUP1	P16649	713 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	PEX2	P32800	271 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	CDS1	P38221	457 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	YBR071W	P38243	211 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	MIT1	P40002	666 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	MFM1	Q02783	413 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	HMG2	P12684	1045 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	DAL3	P32459	195 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	HXT4	P32467	576 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	TIM50	Q02776	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	TRS23	Q03784	219 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	TMA17	Q12513	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	STE4	P18851	423 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	ATP12	P22135	325 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	VPS34	P22543	875 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	MTC7	P32633	139 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	FLO10	P36170	1169 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	MRPL7	P36519	292 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	RIM4	P38741	713 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	PEF1	P53238	335 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	TGS1	Q12052	315 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	SEC12	P11655	471 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	LOT5	P34234	306 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	PAF1	P38351	445 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	YIP4	P53093	235 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	MDR1	P53258	950 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	HOL1	P53389	586 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	CPR8	P53728	308 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CMC1	YKL137W	ULA1	Q12059	462 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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