RNA–Protein interactions for RNA: YHL002W

HSE1, Transcript of Subunit of the endosomal Vps27p-Hse1p complex, yeast

Gene HSE1, Length 1,359 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HSE1	YHL002W	STE12	P13574	688 aa		5	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	PAC2	P39937	518 aa		5	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	TMN3	P40071	706 aa		5	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	PMT6	P42934	759 aa		5	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	VID28	P40547	921 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	MRK1	P50873	501 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	YGL081W	P53156	320 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	FDC1	Q03034	503 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	COQ11	Q05892	277 aa		4.99	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	PHO5	P00635	467 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	DGR2	P32330	852 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	YHR033W	P38690	423 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	MIT1	P40002	666 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	THI6	P41835	540 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	SNF12	P53628	566 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.98	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	PPE1	P38796	400 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
HSE1	YHL002W	FTR1	P40088	404 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	YDR179W-A	Q03983	463 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	AIM44	Q99299	758 aa		4.97	□□□□□ -1.61
HSE1	YHL002W	CDC26	P14724	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	CEF1	Q03654	590 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	HLR1	Q04429	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	ADE5,7	P07244	802 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
HSE1	YHL002W	VPS34	P22543	875 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	CDS1	P38221	457 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	UBP12	P39538	1254 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	PRM2	P40534	656 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	AIM41	Q12032	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	TPK2	P06245	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	TUP1	P16649	713 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	TIM50	Q02776	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	TRS23	Q03784	219 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	THI7	Q05998	598 aa		4.94	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
HSE1	YHL002W	STE4	P18851	423 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	DAL3	P32459	195 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	PIH1	P38768	344 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	MFM1	Q02783	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	FMP30	Q02883	468 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	RMP1	Q12530	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	YMC1	P32331	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	YEN1	P40028	759 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	SKY1	Q03656	742 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	YCG1	Q06680	1035 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	ULA1	Q12059	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.92	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	ORC2	P32833	620 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	MRPL7	P36519	292 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	RIM4	P38741	713 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	ATP12	P22135	325 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	HXT4	P32467	576 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	EUG1	P32474	517 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	MTC7	P32633	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	YIP4	P53093	235 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	YGL117W	P53133	265 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	CPR8	P53728	308 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
HSE1	YHL002W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	HMG2	P12684	1045 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	CNE1	P27825	502 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	EHT1	P38295	451 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	ATG36	P46983	293 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	SQS1	P53866	767 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	YDL073W	Q07454	984 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	OSW1	Q08692	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.9	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	MDM10	P18409	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	AEP2	P22136	580 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	CAP1	P28495	268 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	GRX4	P32642	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	PEA2	P40091	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	SPC105	P53148	917 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	ARG7	Q04728	441 aa		4.89	□□□□□ -1.63
HSE1	YHL002W	TRE2	Q08693	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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