RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	MET3	P08536	511 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	FAR1	P21268	830 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	MSM1	P22438	575 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	YEL1	P34225	687 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	LHS1	P36016	881 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	SRL3	P36167	246 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	HSM3	P38348	480 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	VPS8	P39702	1274 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	ELO3	P40319	345 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	FKH2	P41813	862 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	ORM1	P53224	222 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	DSL1	P53847	754 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	FMP30	Q02883	468 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	NRG1	Q03125	231 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	DLT1	Q04216	342 aa		3.66	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	HAP1	P0CE41	1502 aa		3.65	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	LYS2	P07702	1392 aa		3.65	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	RKR1	Q04781	1562 aa		3.65	□□□□□ -1.82
ECO1	YFR027W	YSP2	Q06681	1438 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	CAF20	P12962	161 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	MIH1	P23748	554 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	CLB4	P24871	460 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	HOG1	P32485	435 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YSW1	P38280	609 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YBR259W	P38338	688 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SUL1	P38359	859 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SPT8	P38915	602 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SPC72	P39723	622 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YIL092W	P40497	633 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SDS3	P40505	327 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	VID28	P40547	921 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	NPA3	P47122	385 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	AMA1	P50082	593 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YGL081W	P53156	320 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	VTC3	Q02725	835 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YML108W	Q03759	105 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	KRE28	Q04431	385 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	ASM4	Q05166	528 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	CRR1	Q05790	422 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	DNL4	Q08387	944 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SLK19	Q08581	821 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YLR149C	Q99296	730 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	DNF2	Q12675	1612 aa		3.65	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	BNR1	P40450	1375 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	ALG7	P07286	448 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	BIK1	P11709	440 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	HMG1	P12683	1054 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	DAL5	P15365	543 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SWC3	P31376	625 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PPG1	P32838	368 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	COY1	P34237	679 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	HEL1	P36113	551 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YBR053C	P38235	358 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YLF2	P38746	405 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	KEL2	P50090	882 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	MUP1	P50276	574 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YGL082W	P53155	381 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	RTS3	P53289	263 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	NCS2	P53923	493 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	NHX1	Q04121	633 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	FUS2	Q05670	677 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	ADY4	Q05955	493 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	STE23	Q06010	1027 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	FRE5	Q08908	694 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	TGL5	Q12043	749 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	ATG11	Q12527	1178 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PDR18	P53756	1333 aa		3.64	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	CDC31	P06704	161 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PMR1	P13586	950 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	TUP1	P16649	713 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	PCL2	P25693	308 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SEC6	P32844	805 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	OAR1	P35731	278 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	HSL7	P38274	827 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	EFM2	P38347	419 aa		3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83
ECO1	YFR027W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	3.63	□□□□□ -1.83

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 15.6 ms